专栏名称: 小张聊科研
聊聊跟科研有关的感想心得,如基金,文章和实验。
目录
相关文章推荐
国际新闻界  ·  越界游戏:与GPT的“生死”爱恋及其示能之思 ·  3 天前  
募格学术  ·  同济大学发布讣告 ·  3 天前  
51好读  ›  专栏  ›  小张聊科研

实验做不出来还有理了?是的!

小张聊科研  · 公众号  · 科研  · 2017-05-18 18:33

正文

实验结果做不出来,是大家最愁的问题;重复别人的实验结果没有出来,严重者会让我们怀疑人生。今天我们就从一个“双刃剑”效应说说科研里面出现的各种“似是而非飘忽不定前后矛盾”的情况,希望能帮大家找到问题的解决办法(或者,跟导师解释实验为什么做不出来的时候不至于没有话说)。


我们先看几篇文章:
1. NKX2-1/TTF-1: an enigmatic oncogene that functions as a double-edged sword for cancer cell survival and progression.Cancer Cell2013 Jun 10;23(6):718-23.

转录因子NKX2-1/TTF-1在肿瘤细胞中的两面性:促进和抑制肿瘤。

2. Autophagy as a Double-Edged Sword in Pulmonary Epithelial Injury: A Review and Perspective. Am J Physiol Lung Cell Mol Physiol. 2017 May 4:ajplung.00562.2016. doi: 10.1152/ajplung.00562.2016

细胞自噬对于呼吸上皮细胞损伤发挥双面作用:细胞保护和杀伤。

3. Interleukin-17 acts as double-edged sword in anti-tumor immunity and tumorigenesis.Cytokine. 2017 Jan;89:34-44. doi: 10.1016/j.cyto.2015.09.011

IL-17 在肿瘤发挥双面作用:促进和抑制。

当然,除了IL-17,还有其它的细胞因子,:

  • Interleukin-22 Might Act as a Double-Edged Sword in Type 2 Diabetes and Coronary Artery Disease.Mediators Inflamm. 2016;2016:8254797. (IL-22在二型糖尿病和冠状动脉疾病中发挥双面作用)

  • Interleukin-6 prevents the Initiation but Enhances the Progression of Lung Cancer.Cancer Res. 2015 Aug 15;75(16):3209-15.IL-6抑制肺癌发生但是促进肺癌进展

  • Role of cytokines as a double-edged sword in sepsis.

4. DNA damage response--a double-edged sword in cancer prevention and cancer therapy.Cancer Lett. 2013 Nov-Dec;27(6):669-84.

DNA损伤在肿瘤预防和治疗中的两面性。

5. The double-edged sword of AMPK signaling in cancer and its therapeutic implications.Arch Pharm Res. 2015 Mar;38(3):346-57. 

AMPK信号通路在肿瘤治疗中的双面性:促进和抑制癌症。


除了文章以外,基金也有这样的“两面三刀”情况:

  • 热休克转录因子4(Hsf4)对晶状体纤维细胞分化的双刃剑调控

  • IL-17a在肺炎链球菌中耳炎固有免疫应答和组织损伤中的"双刃剑"作用机制研究

  • Nox4介导ROS生成在心肌缺血性损伤中的双刃剑作用及其机制研究

  • 大鼠心肌多胺代谢规律和“双刃剑“作用机制的研究


通过上面的案例,我们想说的是:不管是细胞过程(比如细胞自噬),生物学过程(DNA损伤),信号通路(AMPK通路)还是分子(转录因子),都有可能在我们关心的疾病中扮演“双面间谍”作用,原因也是我们一直在说的:研究核心不够精确,所以我们要细化


1. 从通路细化到基因,从基因细化到分子(DNA、RNA,蛋白以及不同转录本),从分子细化到序列,序列的作用要看结构和条件。一条通路中的不同基因功能相反大家容易理解,一个基因从不同层面(DNA、RNA抑或是蛋白)形式发挥相反功能的报道也越来越多,一个基因的不同转录本(分子)可以是mRNA,lncRNA或者是circRNA,它们的作用也可能不同乃至相反,一条RNA分子序列突变会导致其功能改变,而相同的序列在形成不同结构的时候功能可能也不同,这个就是分子生物学的复杂性。

2. 把疾病细化为不同的阶段或者主题,在不同的阶段选择不同的组织,将组织分解为不同的细胞类型,将细胞进一步分解为亚细胞单位,这个是疾病的复杂性。


对我们来说,大部分情况下就是在这么复杂的系统里面展开垂直研究,前人的研究已经把点(比如基因)连成了线(分子间作用),把线连成了网络(信号通路),把网络在某个单位(某种细胞)中的作用进行了研究,把单位与疾病的关系进行了联系,再考虑到时间因素,就成了一个复杂至极的系统,这个系统很多地方我们还未知,也有很多bug,我们就是系统里面一个个维修工,为了现实中各种各样的目的参与到其中。


长按二维码识别关注“小张聊科研”

关注后获取《科研修炼手册》1.0、2.0、3.0、4.0、基金篇精华合集