1天双响！曹雪涛/钟南山等多团队合作取得新突破

iNature

肺部感染后肺如何实现免疫稳态尚不完全清楚。

2024年10月16日，南开大学，中国医学科学院/北京协和医学院，华大基因，昌平实验室及广州实验室等多单位合作，曹雪涛，汪建、刘龙奇、秦川、任仙文及钟南山等团队合作在 Cell Discovery 在线发表题为“ Single-cell spatiotemporal analysis of the lungs reveals Slamf9 ⁺ macrophages involved in viral clearance and inflammation resolution ”的研究论文，该研究 分析了叙利亚SARS-CoV-2感染仓鼠模型严重肺炎自然恢复2周内肺部的时空变化。

该研究发现SARS-CoV-2感染多种细胞类型，并在早期引起大量细胞死亡，包括肺泡巨噬细胞。该研究鉴定了一组单核细胞来源的Slamf9 ⁺ 巨噬细胞，它们在SARS-CoV-2感染后被诱导，并对SARS-CoV-2引起的损伤具有抗性。Slamf9 ⁺ 巨噬细胞含有SARS-CoV-2，招募Isg12 ⁺ Cst7 ⁺ 中性粒细胞并与之相互作用以清除病毒。病毒清除后，Slamf9 ⁺ 巨噬细胞分化为Trem2 ⁺ 和Fbp1 ⁺ 巨噬细胞，参与后期炎症消退，最终补充肺泡巨噬细胞。这些发现在 SARS-CoV-2 感染的hACE2小鼠模型中得到了验证，并得到了公开的人体尸检单细胞RNA-seq数据的证实，证明了 Slamf9 ⁺ 巨噬细胞及其与中性粒细胞的协调在损伤后组织修复和炎症消退中的潜在作用。

另外， 2024年10月16日， 南开大学，中国医学科学院/北京协和医学院，华大基因，昌平实验室及广州实验室等多单位合作，曹雪涛，汪建、刘龙奇、秦川、任仙文及钟南山等团队合作 在 Cell Discovery 在线发表题为“ Single-cell spatiotemporal analysis reveals alveolar dendritic cell–T cell immunity hubs defending against pulmonary infection ”的研究论文，该研究将免疫制图技术应用于 SARS-CoV-2 感染的叙利亚仓鼠模型，这是一种高分辨率技术，通过反卷积和共定位分析整合了空间和单细胞RNA测序（scRNA-seq）。该研究以25只仓鼠的142,965个细胞和45个肺叶为样本，在器官尺度和单细胞分辨率上绘制了从生理状态、感染起始、严重肺炎到自然恢复的肺部感染全过程的综合转录组图。综合分析发现肺泡树突状细胞-T细胞免疫中枢，其中Ccr7 ⁺ Ido1 ⁺ 树突状细胞、Cd160 ⁺ Cd8 ⁺ T细胞和Tnfrsf4 ⁺ Cd4 ⁺ T细胞生理性共定位，在SARS-CoV-2感染期间迅速扩张，借助Slamf9 ⁺ 巨噬细胞消除SARS-CoV-2，然后在病毒清除后恢复到生理水平。 总之，该研究在正常和 SARS-CoV-2 感染的hACE2小鼠模型以及公开的人类scRNA-seq数据集中验证了这些细胞亚群在免疫中心的存在，证明了该研究的发现在肺免疫中的潜在广泛相关性。