贝勒大学医学院的研究人员证实22q11.2区的crkl基因突变可导致新生儿泌尿生殖系统发育障碍。
第22号染色体是人类第二小的一条染色体,也是第一个完成测序的染色体,全长包括500-600个基因。
22号染色体的22q11.2区一直是出生缺陷研究的热点区域。大约1/4000的新生儿存在着22q11.2区的变异问题,这造成了大约40个基因的缺失或重复拷贝。
22q11.2微缺失对身体系统发育影响很广,程度和具体表现都不一样,这一区域的许多基因目前都没有得到很好的了解。只知道有时会造成心脏发育和功能障碍,有时是免疫系统,有时是颅面部的严重破坏,还有时是认知和行为问题。其中约30%的患者出现泌尿生殖系统发育异常和上、下呼吸道缺陷,这些患者被统称为DiGeorge综合征或22q11.2微缺失综合征。
作为DiGeorge综合征的一部分或孤立的先天性畸形的一种,先天性的泌尿生殖系统缺陷是最常见的出生缺陷之一。每250名足月男婴之中便有1人因隐睾和尿道下裂被定义为泌尿生殖系统出生缺陷。该出生缺陷也是Dolores
Lamb博士实验室多年来的研究焦点。
Lamb说:“大约12年前,我们开始用阵列比较基因组杂交技术(array comparative genomic
hybridization)来研究泌尿生殖系统的先天性缺陷。它本质上是一种具有很高分辨率的分子核型(molecular
karyotype),让我们看到染色体区域的微小缺失或增加。使用这种技术我们比较分析了大量的尿道下裂或隐睾患儿的染色体,约20%的人的不同染色体上的特定区域具有微缺失(microdeletions)或微重复(microduplications),其中就包括了22q11.2区。但是,这些孩子并非DiGeorge综合征患者(先天性无胸腺或胸腺发育不全)。”通过基因测序研究人员还发现,发生变化的基因是从头合成(de
novo)的,意味着父母体内不存在这些变化。
Lamb和同事们觉得22q11.2区的基因最有可能参与了泌尿生殖系统发育异常,如果能找到并破解相关基因的功能,就可以开发具有针对性的诊断工具和潜在的治疗手段。
用患者基因组数据和动物模型理解泌尿生殖系统缺陷
找到这些与发育障碍有关的基因的过程,就好比不给你设计图,却让你从一架复杂的、老旧的机器中找到缺失或发生改变的零件。因此,科学家们使用了多种策略来寻找候选基因,同时在体外体内模型中测试它们的功能。
Lamb课题组采用了一个双管齐下的方法。他们使用了同时具有生殖异常症状的DiGeorge综合征患者的基因样本,重点检查了22q11.2区基因缺失和重复的拷贝数量变异。
得益于科学家们对潜在信号通路的了解,凭借着仅有的一点线索,他们很快锁定了一个名叫
CRKL
的基因,该基因的缺失或重复最有可能参与了泌尿生殖系统的发育障碍。
进一步的分析表明,人类胎儿的多处组织都表达
CRKL
,包括新、肝、肺、骨骼肌、脾脏、胸腺、脑和肾,这些器官都与DiGeorge综合征有关。小鼠和人类的整个发育过程,包括泌尿生殖道发育,
CRKL
都持续的轻微表达,这使研究人员更加确定
CRKL
参与了生殖系统发育。