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小技巧 | 根据基因点突变快速建立3D蛋白质空间结构模型

基因检测与解读  · 公众号  ·  · 2017-08-05 07:06

正文

  临床医生找到致病突变后想发文章,一般都需要模拟一下该突变的3D分子模型,如果请人帮助可能会用到PyMOL等专业软件,今天游侠就介绍一个在线网站快速构建3D蛋白质空间结构模型。

 

输入网址http://www.cmbi.ru.nl/hope/


我们以AARS2:NM_020745:exon3:c.T452C:p.M151T 为例来说明一下如何操作。

首先在网站http://www.uniprot.org/找到AARS2转录本对应的氨基酸序列,粘贴在Input Sequence,然后点击NEXT

选择151M

突变为T


等上几分钟


 

结果展示的非常丰富,还有3D动态图片。

紫色代表突变氨基酸在整个蛋白中的空间位置。

绿色为野生型氨基酸,红色为突变型氨基酸。