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【flowjo】流式笔记:流式也能画t-SNE图?

生信菜鸟团  · 公众号  · 生物  · 2024-12-04 12:30

正文

哦莫哦莫!!!这竟然是用flowjo画出来的,岂不是能够和单细胞图谱很好地结合互为验证~

tSNE - FlowJo Documentation: https://docs.flowjo.com/flowjo/advanced-features/dimensionality-reduction/tsne/)

FlowJo多通道tSNE降维流式分析图 - https://www.bilibili.com/opus/732115658681090169)

以小鼠骨髓为例,就能得到:

图中只显示了部分细胞亚群哦~


然后,昨晚在群里有小伙伴发现了单细胞数据密度图,⬇

这不就是流式的密度图??

问题在于,这是咋做出来的?

所以这个图应该是基于 BBrowser 平台做的, https://bioturing.com/bbrowser/download (这是收费的~)

如果课题组经费充足,而单细胞分析的水平有限,推荐去看看这个平台,用户指南➡[https://talk2data.bioturing.com/document#h.i4qjc3yovdg7)







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