目前,从现有数据库挖掘数据进行分析是一个热门领域,生信数据挖掘是直接从现有的数据库挖掘数据进行分析,不用做实验就可以得到一篇生信文章所需要的数据,这个听起来就很有诱惑力。GEO作为生信数据挖掘最常用的公共数据库之一,储存了海量的芯片和二代测序数据,它就像一座宝藏,等待我们去发掘它们的价值,让它们发出光芒。
R语言是一件非常实用并且功能强大的科研分析工具,在平时的科研工作中,即使只达到初级水平,它也可以帮助我们处理excel图表数据,做统计分析,还可以快速做出精美的图片,而这需要的可能仅仅是几行代码。与一些软件相比,R语言更加灵活,不需要套用死板的格式。在GEO数据挖掘中,R语言永远是那把最坚韧的利剑。
小张聊科研“GEO数据挖掘与案例实操班”自开班以来,收到了很多好评,很多学员反映这个课带领他们进入了生信分析的大门,并且也已经有学员上过我们的培训班之后发了文章,我们深感欣慰。
2019年,是新的开始,我们吸纳了学员的一些建议,在原有课程基础上进行进一步的优化,推出“GEO数据挖掘与案例实操班”。本课程立足文章实例,通过GEO实例数据,快速掌握数据分析技巧;梳理发文套路,以实际SCI论文为案例,教你用“别人的”数据,发“自己的”文章;入门R语言,掌握一门重要的科研工具。
课程特点
资深讲师,丰富的项目经验和授课经验;
理论+上机操作,数据挖掘轻松carry;
一次学习终生受用,享受课堂面对面教授;
课上实时与老师交流,有问题当场解决;
内容丰富,数据挖掘与科研绘图合理搭配的精美套餐;
实例操作,让你快速掌握数据挖掘套路。
老师讲课深入浅出,思路清晰易懂,零基础可参加,带您进入生信分析大门;
另外,为了增加学习的互动性和趣味性,增强学员的参与度,并加深对课程内容的理解,现场学员自己从GEO中检索一篇课题相关的GEO数据,所有学员均以此数据进行实战分析,可小组讨论。随后老师会以此数据从下载到得到差异基因的全过程演示一遍。
听完课后我们能达到什么样的程度
1、学会R语言的基本语法
2、学会如何在GEO上检索与我们课题相关的数据
3、如何从GEO上下载我们所需要的数据
4、如何用R语言分析这些数据并作出完成一篇文章所需要的图
5、理清GEO数据挖掘文章的思路,掌握发文套路
课程内容主线
第一天上午:学习R语言基本语法
第一天下午:从GEO下载原始数据并处理
第二天上午:处理后数据纵向扩展
第二天下午:利用处理后数据绘图、介绍文章套路和实战演练
主讲人
小张聊科研团队的资深学术讲师,近十年从事生物信息学和医学相关研究,致力于医学大数据挖掘和软件开发。参与发表十余篇高分SCI文章,并参与“十二五”、“十三五”、863、973重大项目等多项国家级项目的数据分析工作。
适合人群
广大临床/科研工作者,研究生,零基础也可以参加
授课信息
课程表:
第一天 |
8:00-9:00 | 报道,领取资料 |
9:00-12:00 | 数据挖掘介绍及R语言基础 |
数据挖掘与生物信息简介 |
R语言与数据挖掘 (R语言基本语法、函数、循环、包及实例练习) |
12:00-13:00 | 午休 |
13:00-17:00 | GEO实例练习(From Raw data to Clean data) |
GEO简介与在线分析练习 (芯片基础原理,GEO的组成框架,GEO2R差异基因筛选,聚类热图) |
GEO数据下载实例练习 (实际数据下载,FTP批量下载) |
Affymetrix芯片数据分析,差异表达分析 |
随机挑选学员提供的一组数据进行实战分析(小组讨论 + 老师演示) |
17:00-17:30 | 学员提问及讨论 |
第二天
|
9:00-12:00 | 表达谱数据挖掘实战(From Clean data to Results) |
Agilent, Illumina芯片平台原始数据处理,差异表达分析 |
数据分析纵向剖析 (层次聚类,主成分分析,功能富集分析,分子网络构建) |
12:00-13:00 | 午休 |
13:00-17:00 | SCI实用绘图技巧(From Results to Artwork) |
R语言与统计绘图 (R语言绘图系统介绍,点线图、柱形图、箱线图等常规图形制作,气泡图、火山图制作) |
数据挖掘套路解读 (从文献实例出发,剖析生物信息数据挖掘套路,带你轻松发文) |
实战演练 (分小组竞赛练习,重现一篇SCI文章的数据分析结果) |
17:00-17:30 | 学员提问及讨论 |
注:
1、实际授课过程中,老师可能根据学员学习速度对课程进行微调。
2、请学员自带电脑,mac或者windows系统的笔记本(请勿使用XP系统,推荐win10),老师用win10系统进行讲解。
3、本次课程以R语言为核心,贯穿整个课程。
时间:2019年4月13-14日(周六、周日)
酒店:沈阳市沈河区北站路77号 沈阳健晖君悦酒店
注册费(可开发票):
4月6日前 | 4月6日至12日 | 现场缴费 |
3400 | 3600 | 3800 |
二人组团报名,每人可优惠100元
三人组团报名,每人可优惠200元
四人及以上组团报名,每人可优惠300元
注:
1、本次学习班提供两天的午餐,其余食宿费用自理
2、本课程包含配套线上课程“实用数据挖掘”,与线下课程相辅相成,相互补充,作为课前预习和课后复习的资料,此处为优惠价400元,包含在报名费里面,不需要网课的请与特雷西说明。
报名请联系特雷西(微信号:xzlky2015-training),加微信时请注明“姓名+数据挖掘报名咨询”