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16S等扩增子只能大致回答“样品中有什么菌”的问题,而宏基因组不但能回答“样品中有什么微生物”,更重要的是能回答“样品中的微生物有什么功能”。
宏基因组学(Metagenomics),是⼀种直接对微⽣物群体中包含的全部基因组信息进⾏研究的⼿段。它规避了对样品中的微⽣物进⾏分离培养,提供了⼀种对不可分离培养的微⽣物进⾏研究的途径,更真实的反应样本中微⽣物组成、互作情况,同时在分⼦⽔平对其代谢通路、基因功能进⾏研究。
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200-299份
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430
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150-199份
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440
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40-99份
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445
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30-39份
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20-29份
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1.在每份样品6G基础上增加测序分析的数据,按同一项目
增加部分
的总数据计算,实验+分析的费用增加
24-28元/G
,具体梯度如下:(1)<240G,28元/G;(2)240-599G,27元/G;(3)600-899G,26元/G;(4)900-1199G,25元/G;(5)≥1200G,24元/G。例如,100份样品测序数据12G,那么该项目从提取到分析总费用为:100×460元+(12-6)×100×26元=61600元。
测序数据量指raw data。
2.如果不包DNA提取,每份样品便宜
20元
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项目总测序数据(raw data)
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单价(元)
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≥1800G
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30元/G
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1200-1799G
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31元/G
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900-1199G
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32元/G
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600-899G
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33元/G
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240-599G
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34元/G
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180-239G
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35元/G
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120-179G
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36元/G
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36-119G
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37元/G
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注:宏基因组标准纯分析部分,基于reads或组装的分析方式二选一,如果两者都选,按照以上价格的1.5倍收费;如果同时在微科盟做宏基因组标准纯分析以及宏基因组分箱(binning)分析,两者的价格总和是以上价格的1.5倍;宏基因组分箱(binning)分析部分,不管客户给微科盟测序原始数据还是已经组装好的结果,收费标准一样。
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样本数
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单价(元)
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300份及以上
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260
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200-299份
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150-199份
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270
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100-149份
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275
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40-99份
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280
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10-39份
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285
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注:
1.在每份样品6G基础上增加测序的数据,按同一项目
增加部分
的总数据计算,测序的费用增加
20-25元/G
,具体梯度如下:(1)<240G,25元/G;(2)240-599G,24元/G;(3)600-899G,23元/G;(4)900-1199G,22元/G;(5)1200-1799G,21元/G;(6)≥1800G,20元/G。例如,100份样品测序数据12G,那么该项目从提取到测序总费用为:100×285元+(12-6)×100×23元=42300元。
测序数据量指raw data。
2.如果不包DNA提取,每份样品便宜
20元
。
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项目周期
最快只需要25个工作日!!
实验路线
样品准备→DNA检测→文库构建(加接头)→文库检测→上机测序→下机质控→信息分析
技术路线
交付结果目录
[序列质控和去宿主的相关信息]
[整体物种的注释与评估主要相关信息]
[常用的功能数据库注释相关信息]
[抗性基因注释主要相关信息]
[本报告的图表文件夹]
部分交付图表示例
宏基因数据分析系统
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注:
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深圳微科盟科技集团有限公司简介
深圳微科盟科技集团有限公司
(Wekemo Tech Group Co., Ltd. Shenzhen China)
,专注微生态研究
,是深圳大学孵化和无偿资助的高新技术企业,总部位于深圳大学城。
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微科盟
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