在网页版的Rstuio加载Seurat时,等待了很久都没有成功,刷新网页后就出现了如下的提示
报错信息
测试了其他包,例如ggplot2,都没有任何问题,唯独是Seurat出现了问题,因此我用关键词"seurat cause rsession terminated" 进行搜索,发现有人在Rstudio的社区上提出了这个问题,看来我并不是一个人遇到这个问题。
我尝试里帖子https://community.rstudio.com/t/r-studio-crashes-when-loading-seurat-package/57931的解决方法,也就是卸载reticulate, 卸载Seurat,然后重装Seurat,但是对我而言没有什么效果。
remove.packages('reticulate')
remove.packages('Seurat')
install.packages('Seurat')
library(Seurat)
同时有人在Seurat的GitHub中提出了这个问题,作者认为这个问题只会在Rstudio中出现,因此关闭了Issue。换句话说,这可能是Rstudio独享的moment。
我又测试了重启Rstudio服务器,发现这也没有什么效果。
甚至将我的Rstudio-server升级到最新版本,也没有解决这个问题。
并且更令人吃惊的是,这个问题只在我的用户中存在,其他用户并没有这个报错。
因此,目前我想到了下面几种解决方法:
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等待Rstudio-serve更新的版本解决这个问题
难受。。。
目前在Jupyter notobook使用R,感觉良好。我可能要暂时告别网页版的RSstudio了。