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“普瑞基准”
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通过基哥上周的描述,我们知道目前研究较多的几个肿瘤
bio-marker
包括
TMB
(Tumor Mutation Burden,
肿瘤突变负荷
)
、
MSI
(
Microsatellite Instability
,
微卫星不稳定性
)、
MMR
(
Mismatch-repair Deficiency
,
错配基因修复缺失
)和
肿瘤新抗原
(Tumor Neoantigen)。其中的
TMB
在
AACR 2017 大会上可谓是出尽风头,在
对 CheckMate-026 三期临床试验进行回顾性研究中,研究人员利用
TMB
表达的高低
有效的区分了
Opdivo 治疗 NSCLC 的获益人群。
而在之前普爷的
视频
(
点击
蓝字
观看视频)
中我们看到,肿瘤新抗原是决定免疫治疗是否有效的重要因素,因此,这一周基哥就来说说
肿瘤新抗原
那些事儿。
所谓的
肿瘤新抗原
,指的是一种位于肿瘤细胞表面主要组织相容性复合体(
MHC-I
)的抗原表位肽。这些抗原不同于正常体细胞表面的人类主要组织相容性抗原 HLA,是源自肿瘤特有的突变,具有肿瘤特异性因而能够被 T 细胞识别并引起
免疫应答
。
Naiyer A. Rizvi 在 2015 年 4 月发表于《
Science
》的论文中发现,非小细胞肺癌患者采用 PD-1 药物治疗时,患者的治疗获益与 TNB 的高低显著相关(
图 A
)
。
图片来源
:
Science.
2015 Apr 3;348(6230):124-8. doi: 10.1126/science.aaa1348. Epub 2015 Mar 12.
注:
DCB(durable clinical benefit),NDB(no durable benefit)
TNB 高
的患者采用
PD-1
药物治疗时,无进展生存期明显
高
于 TNB 低表达的患者(
图
B
)。
Matthew M. Gubin 于 2015 年 11 月发表在《
The Journal of Clinical Investigation
》的一篇综述中,重点讨论了肿瘤新抗原在肿瘤免疫治疗中的应用。
图片来源:
J Clin Invest.
2015 Sep;125(9):3413-21. doi: 10.1172/JCI80008. Epub 2015 Aug 10.
如上图:通过对患者的肿瘤细胞和正常组织进行全外显子和转录组测序,鉴定筛选出表达的非
同义体细胞突变。利用这些突变信息进行 MHC-I(
Major Histocompatibility Complex,
主要组织相容性复合体
I 类
)表位预测算法中预测可能形成
新生抗原
的突变,或者通过制备小基因串进行表达,扩增和分离从血液或肿瘤组织分离出的 TIL 细胞,鉴定出能够特异性识别突变新生抗原肽的 TIL。体外进一步扩增此类 TIL 细胞再回输给该肿瘤患者。或者,转录组测序表达的突变多肽经过 MHC-I 表位预测能形成新生抗原的可以用于生成
新生抗原疫苗
。
针对肿瘤免疫治疗,普瑞基准团队今年四月初发布了自主研发的独立产品
昂可星
TM
OncoBuster
TM
,
该产品通过对肿瘤组织的全外显子和转录组测序及大数据分析,评估肿瘤
突变负荷
,
筛选预测能高效激活免疫反应的
肿瘤
特异性
新抗原
,可以协助医生:根据患者的主要组织相容性复合体分型,寻找能引发强烈免疫应答的新表位(Neoepitopes),获得针对肿瘤细胞特异性
新抗原
(Neoantigen)和针对新抗原表位具有高效应的精准 T 细胞,再通过扩增和过继回输治疗,诱导富集 PNA-T 细胞实现对肿瘤患者的精准免疫治疗。
参考文献:
附-名词解释:
普瑞基准致力于为肿瘤临床医生提供最全面、精准的多组学分析和解读,为肿瘤精准免疫治疗提供全面、多维度的新生抗原
预测、免疫组库测序和蛋白质组学分析,为患者、医生以及医药企业提供多组学的大数据分析支持。
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