今天介绍一项解放军总医院第二医学中心发表在《中国癌症研究》上的研究：
SOX11 as a potential prognostic biomarker in hepatocellular carcinoma linked to immune infiltration and ferroptosis
，即：《
SOX11
作为与肝细胞癌免疫浸润和铁死亡相关的潜在预后生物标志物
》。
研究主要发现：
SOX11
在肝细胞癌（
HCC
）中表达显著上调，与肿瘤分期、分级及预后密切相关，还与免疫细胞浸润和铁死亡相关基因显著相关，有望成为
HCC
诊断和预后的生物标志物。
肝细胞癌（
HCC
）是全球第五大常见癌症，也是癌症相关死亡的主要原因之一。
SOX11
这一基因在多种癌症中表现出异常表达，并且与肿瘤的发生、发展和预后密切相关。然而，
SOX11
在
HCC
中的具体作用尚不清楚。
初步探索：
SOX11
在
HCC
中的表达差异
研究团队首先利用公共数据库（如
TCGA
和
GEO
）获取
HCC
患者的转录组数据，并通过
TIMER2.0
工具分析
SOX11
在肿瘤组织和正常组织中的表达差异。结果显示，
SOX11
在
HCC
肿瘤组织中的表达显著高于正常组织。进一步分析
TCGA
数据库中的
374
例
HCC
样本，研究团队发现
SOX11
的高表达与肿瘤的
T
分期、病理分期以及肿瘤状态密切相关。
这些初步结果提示研究团队，
SOX11
可能是一个与
HCC
进展相关的基因
。
为了验证这一发现，研究团队进一步利用免疫组化（
IHC
）技术检测了
HCC
组织切片中
SOX11
的蛋白表达水平。结果显示，
SOX11
在高级别
HCC
组织中的表达显著高于低级别组织，这进一步支持了
SOX11
与
HCC
恶性程度相关的假设。
深入挖掘：
SOX11
与临床预后的关联
既然
SOX11
的表达与
HCC
的临床特征密切相关，研究团队接下来探索其是否可以作为预后标志物。通过
Kaplan-Meier
生存分析，研究团队发现
SOX11
高表达的
HCC
患者总体生存率（
OS
）、疾病特异性生存率（
DSS
）和无进展生存率（
PFI
）均显著低于
SOX11
低表达的患者）。多因素
Cox
回归分析进一步证实，
SOX11
是一个独立的预后预测因子。
这些结果表明，
SOX11
不仅与
HCC
的临床特征相关，还可能影响患者的预后。
基于这些发现，研究团队构建了一个包含
SOX11
水平、
T
分期、病理分期、
AFP
水平和肿瘤状态的列线图模型，用于预测
HCC
患者的
1
年、
3
年和
5
年生存率。该模型的
ROC
曲线下面积（
AUC
）为
0.747
，表明
SOX11
具有较好的诊断和预后预测能力。
进一步探索：
SOX11
的功能机制
为了深入理解
SOX11
在
HCC
中的作用机制，研究团队利用
LinkedOmics
分析了与
SOX11
共表达的基因，并通过
GO
和
KEGG
富集分析探讨其功能。结果显示，
SOX11
可能参与细胞外基质
-
受体相互作用和视黄醇代谢等生物学过程。
这些通路与细胞增殖、迁移和侵袭等肿瘤生物学行为密切相关，提示
SOX11
可能通过调节这些通路影响
HCC
的进展。
此外，研究团队还关注到
SOX11
与免疫细胞浸润之间的关系。通过单样本
GSEA
（
ssGSEA
）分析，研究团队发现
SOX11
的表达与多种免疫细胞的浸润程度显著相关，例如
T
滤泡辅助细胞（
TFH
）、
Th2
细胞和巨噬细胞。这些免疫细胞在肿瘤微环境中发挥重要作用，可能影响肿瘤的免疫逃逸和进展。进一步分析发现，
SOX11
的表达与多种免疫检查点基因（如
CTLA4
、
CD276
等）的表达水平也存在显著相关性，
这表明
SOX11
可能通过调节免疫微环境影响
HCC
的进展。
实验验证：
SOX11
对细胞增殖和迁移的影响
为了进一步验证
SOX11
在
HCC
细胞中的功能，研究团队在
HepG2
和
HuH7
细胞系中进行了
SOX11
的敲低实验。通过
Western blotting
验证了
SOX11
的敲低效率。随后的
CCK-8
实验和划痕实验结果显示，
SOX11
的敲低显著抑制了
HCC
细胞的增殖和迁移能力。这些实验结果支持了
SOX11
在
HCC
细胞增殖和迁移中的促进作用，进一步证实了其作为肿瘤促进因子的可能性。
更多个性化分析思路和湿实验方案，
扫码合作备注：
i
生信合作
