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《Nature》子刊:最大规模的全基因组肺癌易感性研究

生物通  · 公众号  ·  · 2017-06-14 16:04

正文

在一项由多国研究人员组成的国际研究组项目中,研究人员利用OncoArray基因分型平台,完成了最大规模的全基因组肺癌易感性研究,从中发现了一些新的癌症易感位点。这一研究成果公布在6月12日的Nature Genetics杂志上。 


肺癌是全世界发病率和死亡率最高的癌症之一。每年有超过500万例新发肺癌病例,其中85%属于非小细胞肺癌。这种类型的肺癌主要是由两个亚型代表:肺腺癌和肺鳞状细胞癌。它们可能起源于不同的环境因素或生物过程,但吸烟并不总是主要原因,研究证明肺癌的遗传率约为18%。之前的全基因组关联研究发现了几种肺癌易感基因座,但其中大部分的遗传性仍然无法解释。这项最新研究重新分析了肺癌病例和对照组的基因分型。


这项研究由Norris Cotton癌症中心的Christopher Amos博士,国际癌症研究机构的James McKay博士,以及多伦多大学的Rayjean Hung博士领导完成。涉及样品包括14,803个肺癌样品和12262个已有数据的欧洲人对照样品,总共有29266个样品和56,450个对照。


从中研究人员确定了18个具有全基因组意义的易感基因位点,其中有10个是之前从未发现过的。这些新的基因位点凸显了肺癌亚型:肺腺癌和肺鳞状细胞癌易感模式的显著变化——4个与整体肺癌相关,6个位点与肺腺癌相关。研究人员也发现了与端粒功能相关的几个基因,它们在肺腺癌易感风险中扮演了重要的角色,但是对肺鳞状细胞癌易感风险并无显著影响。


Amos表示:“这项研究中最令人兴奋的是影响肺癌的新基因发现。研究为分析肺癌患病风险提供了新的见解,而且特别重要的是我们发现了几个影响端粒功能的新突变,也会影响肺腺癌易感风险。同时我们也发现了烟碱受基的一种亚基周围出现了突变,这种亚基能影响肺癌患病风险,吸烟习惯,而且似乎在小脑中起重要作用,后者很少涉及成瘾行为的影响。”


未来通过进一步的研究将更好地了解靶基因在影响肺癌风险,吸烟行为和吸烟对脑生物学影响方面的作用。


除此之外,近期Nature Genetics杂志也在肺癌细胞中发现了一些新的驱动突变(driver mutations),可能用于基因靶向治疗和免疫治疗。


研究人员检查了来自于两种最常见肺癌类型的1144个基因组分析谱:肺腺癌和肺鳞状细胞癌。这项研究的高度统计显著性,可让研究人员能够识别影响几个蛋白质(负责细胞中的信号)的新型驱动突变。在这项研究中,科学家使用统计方法,来区分驱动突变和所谓的过客突变(passenger mutations),这些突变发生在癌症的发展过程中,但不会引发肿瘤生长。

肺癌侵袭性竟是其致命弱点?!


原文标题


Large-scale association analysis identifies new lung cancer susceptibility loci and heterogeneity in genetic susceptibility across histological subtypes