专栏名称: 弗雷赛斯

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如何计算IC50

弗雷赛斯 · 公众号 · 科研 · 2017-06-20 08:32

正文

本讲的相关配置
· 操作系统和配色方案：WIN7 Home Basic
· 屏幕分辨率：1024×768
· 数据处理软件
- Microsoft Office Excel 2010
- IBM SPSS Statistics 19【可计算IC50】
- GraphPad Prism 5【可计算IC50，本讲推荐】
- Origin 8.5.1

任务：绘制量效曲线，计算IC50

IC50：半数抑制浓度（对应左图），Y轴的研究指标随浓度递减。

EC50：半数有效浓度（对应右图），Y轴的研究指标随浓度递增。
右图其实是把Cell Inhibition当成药物的效应，与药物浓度呈正相关。
其实对于细胞毒实验，两者是相等的。
如果药物有抑制细胞活性的作用，习惯上称之为IC50（称呼而已）。

【实例操作1】细胞毒实验计算IC50

· 细胞毒实验：SRB法，MTT法
· 阴性对照组Concrol：给药浓度为0的含细胞的孔，实验中以该组细胞活力当成100%。
· 空白组Blank：无细胞的孔，用于吸光度的调零（扣掉96孔板自身的一点儿吸光度）。

拓展知识：计算IC50的其他方法

方法1：前面已演示，用Excel计算Mean，SD和N，转换成百分数后用GraphPad计算。注意选择normalized Response-Variable slope。

方法2：XY→Use sample data→Dose response，直接将吸光度值输入GraphPad近似计算。选择response-Variable slope。【快速，但有近似，有主观成分】
方法3：使用SPSS，分析→回归→Probit。
方法4：使用Excel，对中间呈线性的几个点进行线性拟合，用线性方程来近似计算。【简易，但有近似，有主观成分】

未

完

待

续

浩然专栏

张浩然，男，北京大学药学博士，创作了被广为传播的课程《科研实用电脑技巧四部曲》，内容涉及科研工作者的实用电脑技巧及相关软件。等不及想看四部曲？给我们发送H002，打包给你哦。