1. 唾液DNA(头颈部肿瘤检测)
唾液是一种极易获得的体液,并且具有无创的优势。唾液DNA的甲基化状态也被大量研究证实与head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC)的早期检测相关,具体可见下表(table1)
2. 痰液DNA(肺癌检测)
痰液中DNA甲基化状态可以用来检测早期肺癌。肺癌是世界上死亡率最高的癌症,LDCT已经被NCCN指南推荐用于在高危人群中筛查肺癌。同样的,痰液中包含的肿瘤细胞和肿瘤特异的DNA也可以用来诊断肺癌。和CT相比,痰液的检测更加是一种无创和方便的方式。经过过去几十年的努力,在痰液中检测特定基因的甲基化位点去诊断肺癌,已经有许多文献报道可行。
3. 粪便DNA(结直肠癌检测)
FOBT(fecal occult blood test)一直以来是结直肠癌(CRC)筛查的经典手段,一项临床研究比较无症状、≥50岁普危组人群粪便DNA与FIT检查,二种检查在同一标本中进行,所有参加者都进行结肠镜检查作为参考标准,共入组9989名参检人。粪便DNA检查包括分子分析与结直肠恶性肿瘤相关DNA突变和甲基化标志(KRAS突变、 NDRG4和 BMP3甲基化水平)。结果显示,DNA检查检测结直肠癌的敏感性是92.3%,FIT是73.8%。DNA检查检测癌前病变的敏感度42.4%,FIT是23.8%,上述结果皆有统计学差异。SEPT9基因的启动子高甲基化与结肠直肠癌的发展高度相关。基于针对SEPT9启动子甲基化的PCR的回顾性实验发现,SEPT9启动子甲基化对结直肠癌检测的灵敏度为 72% ~90%,特异度为 88% ~90% 。同样的,也有许多报道表明粪便DNA的甲基化检测可以对CRC或者腺瘤进行检测,具体见Table 3。
4. 尿液DNA(膀胱癌检测)
对膀胱癌患者尿液中DNA甲基化的研究已经有很多报道,在这些大量的报道中,却没有一个DNA甲基化生物标志物表现出临床应用的潜质。或许是由于之前的方法只能同时检测少许几个特异的甲基化位点,因此影响了其表现。在这一部分,我们对DNA甲基化生物标志物用于前例腺癌检测的研究进行了系统回顾,具体见table 4
5. 尿液DNA(前例腺癌检测)
相对于膀胱癌检测的研究来说,前例腺癌患者尿液中DNA甲基化的研究就非常少。而且,几乎所有的研究都包含了GSTP1的甲基化分析。早期的研究认为GSTP1是一个十分理想的前例腺癌检测标志物,而最近的研究则发现其特异性不足。
因此,对于早期前例腺癌的检测,回顾了最近几年的研究,如下表所示(table 5)
总结
体液DNA包含来自于肿瘤的特异的DNA甲基化信号,可在早期对肿瘤进行诊断。对于早期癌症检测来说,DNA甲基化作为生物标志物,无疑是一个很好的选择。可是单个基因的检测灵敏度往往很低。同时分析多个甲基化位点可以极大的提升灵敏度,但同时也提升了检测成本和检测的时间。随着高通量测序技术的发展,运用靶向甲基化panel测序技术,可以同时解决以上问题。