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单晶解析入门第5讲:拿到好的数据,解析就成功了一半!

纳米人  · 公众号  ·  · 2018-10-31 08:13

正文


本文来源:王峰峰,路漫学术单晶解析专栏顾问,小木虫ID:lich666。


有的同学在解析的时候从来没注意过衍射数据的好坏,直接进行解析,但是解析到最后发现数据质量一般,cif检查会报有关数据的错误。其实这些无用功完全可以避免。



使用Xprep中的[A]Absorption...或者[D]Read...选项(前提是利用Xprep确定了正确的空间群),再选[S]Display intensity STATISTICS可以查看衍射数据的统计。


典型的结果如上图所示。图中各列代表意义及一般要求如下所示。

Resolution:数据分辨率,不得低于0.84。

#Data:实际衍射点数。

#Theory:理论衍射点数。

%Complete:完整度=#Data/#Theory,不得低于95%。

Redundancy:数据冗余度,越大越好,大数值有利于吸收校正。多酸尤其需要较大的冗余度。

Mean I:平均衍射强度。一般都呈下降趋势。

Mean I/s:平均信噪比。小于2会被定为不可见衍射点,不可见衍射点过多会报错。

Rint:等效点平均标准误差。不得大于12%。较高可以解析出,但是会报错。

Rsigma:平均信噪比。过大可能出现过多无法解释的峰。

 

上述指标中,分辨率、完整度、平均信噪比、等效点平均标准误差值这四个指标在checkcif过程中会检查。不符合要求会报错。如果收集数据策略有问题,就只能重新收集了。


测试表征学术QQ群:486211358



为进一步提高相关科研人员的晶体结构收录和解析水平,国内领先的科研服务平台学研汇联合路漫学术将于2018年11月24-25日在北京举办单晶结构解析基础讲习班。


主讲人:王峰峰,博士毕业于中国医学科学院药物研究所,专业药物分析,对晶体结构解析颇有心得(小木虫ID: lich666,大柚子)。在药企技术部担任负责人多年,现任某上市药企项目经理。王峰峰老师单晶解析实战经验丰富,在小木虫、学研汇、路漫学术、纳米人等专业学术平台具有极高的声望。

 

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