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生信媛,从1人分享,到8人同行。坚持分享生信入门方法与课程,持续记录生信相关的分析pipeline, python和R在生物信息学中的利用。内容涵盖服务器使用、基因组转录组分析以及群体遗传。
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「生信基础课」如何利用好手头的电脑,节省上千的服务器租用费

生信媛  · 公众号  · 生物  · 2019-07-10 13:49

正文

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对于一个专业的生信分析人员,一台高性能的服务器是必不可少的,因此会在上面投入能力承受范围的资金。

关于为何要用Linux系统,我录制了一个2分钟的视频,https://www.bilibili.com/video/av58133450

但是对于一个仅仅想了解生信是什么, 想跑跑简单的流程的初学者而言,动辄月租上千的服务器并不是好的选择。

最好的策略是先想办法利用好手头的资源,做出一点结果,再去租用更好性能的服务器。当然你要是准备破釜沉舟,像我的一个朋友一样,直接组装出一台上万的服务器,倒逼自己学习,也不是不可以。

怎么做

现在绝大部分人购买的新电脑都预装了Windows10,因此,我录制了2期视频,手把手教大家配置在Windows10上配置好Ubuntu系统,视频地址如下

  • 「转录组入门生信」在Windows10上配置一个Linux环境: https://www.bilibili.com/video/av58244195

  • 「学转录组入门生信」如何用conda安装分析需要的软件 https://www.bilibili.com/video/av58310105

对于MacOS而言,尽管MacOS系统里也有终端,但是和Ubuntu/CentOS这类的Linux系统还是有一些区别的,对于初学者而言,如果不配置好环境,可能也会出现一些问题。同样我也录制了一期视频,教大家如何配置好你的MacOS系统。

  • 「学转录组入门生信」Mac用户应该如何正确配置生信分析环境 https://www.bilibili.com/video/av58541835

这些视频最初是给 一个月能通过转录组入门生信吗? 准备的,对于每个视频,我将一些不必要的部分进行了加速或直接剪掉,为了避免有太多杂音,视频和音频分开录制,所以在剪辑的时候还需要将声音和画面进行对齐。并且为了保证初学者能够理解,我加了字幕讲解所用的代码和目的。 所以 10 分钟 的视频,可能背后是 100分钟 甚至 200分钟 的精力

当然,由于每个人的基础都不太一样,我也只能尽力而为。对于不懂之处,请学会搜索,如果基础实在是薄弱,请加入我们的付费答疑群, 一个月能通过转录组入门生信吗?

阅读原文 便是视频的地址







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