KEGG
信号通路是组学数据分析中最常见的一个，大家多少都见过了：
大家可能遇到过这个现象：在
KEGG
通路富集结果中，经常会出现一些“奇奇怪怪”的通路，之所以说是“
奇奇怪怪
”，
就是因为有些通路明显是与研究主题不相关的。
今天这个“故事”就是小
A
在研究中遇到的，小
A
关注的是
X
基因通过调控
Kupffer
细胞衰老参与肝缺血再灌注损伤的作用机制
，前期已经筛选到一个新基因
X
，并且在
Kupffer
细胞中对
X
进行基因沉默后做的功能富集，结果就拿到了上面组学富集的结果，小
A
就在课题组汇报的时候直接把上面的图贴到
PPT
里面了。汇报的时候，导师看到这个结果后，提了一个问题：
COVID-19
通路富集的很靠前，你这细胞是不是被污染了？你先检测一下是不是被污染了。
要是证明
COVID-19
感染相关通路与肝缺血再灌注损伤的关系，说不定是主刊级别的发现呢！
当然，结果就是小
A
检测后发现并没有被污染，
那为什么
COVID-19
通路还会被富集到呢？
要回答这个问题，就需要了解
2
个基本知识：
a.
KEGG
通路富集的本质就是找相同
，比如你手上有
12
张花色数字不同的牌，然后你发现有
7
张梅花，
3
张数字
8
，
梅花和数字
8
就是富集到的结果
（大致意思）；
b.
每个基因参与的通路有很多
，比如铁死亡的经典指标
GPX4
不仅参与铁死亡信号通路，还有
Glutathione metabolism
（谷胱甘肽代谢）和
Arachidonic acid metabolism
（花生四烯酸代谢）等：
这就导致了一个结果：
当一批基因的功能比较多样化时，富集出来的信号通路也很多，也就是说富集到的通路“共享”了这些基因
