99版5元人民币流通时间短暂，并且已经被05版5元取代，1999年版的一百元纸币，于当年面世，确定了第五套人民币的单一领袖上券面的风格。 在后续面额的票券发行前，还有人以为第五套人民币采用每种面额不同的人物，但事实证明还是采用统一的毛主席素描像。
由于第五套人民币采用国际主流钞票的防伪技术，同时使用在国内国外都知名的主席头像作为钞票主题人物，因此第五套人民币享誉盛名。 但发行后不久，人们就发现1999年版的人民币出现了不少不合理的地方。
央行副行长马德伦所主编的书籍《中国名片——人民币》当中透露99版人民币为何被改版回收的原因， 无外乎背面少了拼音"YUAN"以及防伪技术混乱和质量水平较低这两点， 这才有了后来改进设计并改版的2005版人民币。
一、99版5元券是该版人民币流通时间最短的钞票
99年版人民币除了1元券属于名义上的99版但事实上采用05年版的印钞技术外，其余该版钞票都在2005年后陆续被迅速回收销毁，流通没几年就退出了主流流通领域。
而由于第五套人民币和以往的人民币发行史上一样采取分批发行，因此99年版每种面额实际的流通时间均不同，而作为最晚发行的5元券，偏偏是该版人民币流通时间最短的钞票，
从2002年11月18日发行到2005年8月31日被2005年版取代，其流通时间还不到3年，在没有特殊原因的情况下即被改版回收，几乎是寿命最短的人民币了。
二、99年版5元券背面的年号第一次使用了"彩虹印刷"技术
这是一种文字上的渐变印刷技术，难度很大，颜色上由紫到红进行渐变， 如果不仔细看的话也可以看出明暗颜色的明显渐变，在低面额货币上出现实属难得。但当时第五套人民币采取各印钞厂不断试验的态度， 因此在"1999"末位数的"9"会出现紫色、红色和紫红色几种不同的效果。
