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研究CircRNA的几种常见思路,以及现在还能报国自然吗?

猫头鹰教室  · 公众号  ·  · 2025-01-21 08:51

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关于环状 RNA CircRNA )大家应该都不陌生了,虽然很多人了解 CircRNA 是因为 miRNA lncRNA 角度,当然也有人是通过 RNA m6A 修饰关注到 CircRNA 的( m6A 修饰与 CircRNA 的翻译有关), 不过现在 CircRNA 的研究已经进入了新的阶段—— mRNA 的环化 。从这个角度来说, CircRNA 的研究有些像外泌体: 从一开始关注外泌体在细胞间交互中的角色与机制探索,再到现在工程化外泌体作为核酸药物等递送体系进行干预

下面我就简单梳理一下 CircRNA 研究大致经历的几个阶段。

第一阶段:以 ceRNA 为主要作用机制研究

由于 CircRNA 可以作为 miRNA Sponge 吸附 miRNA 从而调控 miRNA 靶基因的 mRNA 表达,所以这个 ceRNA 机制“流行”了很长一段时间。所以研究 CircRNA 作为 miRNA sponge 算是 circRNA 发挥作用“最经典”的机制了。不过后来情况大家都知道: miRNA lncRNA 为方向 + 国内医院为单位的研究有大量撤稿,现在很多期刊编辑一看是“ miRNA/lncRNA+ 国内医院为单位”的组合,下意识里就想拒稿,到现在还有很多文章在 PubPeer 上被质疑

我看了一下最近被质疑 miRNA 的研究有一个比较通用的问题: 很多研究的 miRNA 只在灵长类中才有,而在小鼠、大鼠这些平时大家用的比较多的模式物种里面根本就没有 ,所以文章大概率是有问题的,有很多文章在被质疑后很快就撤稿了。其实这个问题是很普遍的,原因在于没有考虑物种的保守性,我记得 5 6 年前看很多人的本子就经常出现这个问题: 由于很多申请人关注的 lncRNA 是从动物模型中筛选出来的,还是在疾病模型中高表达并且已经验证了有功能,但是最后突然发现这个 lncRNA 居然在人里面不保守或者根本不表达,虽然从文章上来说还好,但是从基金申请来说临床意义一下就打折扣了 ,这样就有很多本子被毙掉。

第二阶段:以 RNA 结合蛋白 RBP 为主要作用机制的研究

除了 miRNA 外, RNA 结合蛋白 RBP 是大家研究 CircRNA 的另外一个常见机制。 由于 RNA 结合蛋白所参与的功能不同,实际上 CircRNA 发挥作用的方式差别也很大, 实际上作为 RNA







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