关于环状
RNA
(
CircRNA
)大家应该都不陌生了,虽然很多人了解
CircRNA
是因为
miRNA
和
lncRNA
角度,当然也有人是通过
RNA
的
m6A
修饰关注到
CircRNA
的(
m6A
修饰与
CircRNA
的翻译有关),
不过现在
CircRNA
的研究已经进入了新的阶段——
mRNA
的环化
。从这个角度来说,
CircRNA
的研究有些像外泌体:
从一开始关注外泌体在细胞间交互中的角色与机制探索,再到现在工程化外泌体作为核酸药物等递送体系进行干预
。
下面我就简单梳理一下
CircRNA
研究大致经历的几个阶段。
第一阶段:以
ceRNA
为主要作用机制研究
由于
CircRNA
可以作为
miRNA Sponge
吸附
miRNA
从而调控
miRNA
靶基因的
mRNA
表达,所以这个
ceRNA
机制“流行”了很长一段时间。所以研究
CircRNA
作为
miRNA sponge
算是
circRNA
发挥作用“最经典”的机制了。不过后来情况大家都知道:
以
miRNA
、
lncRNA
为方向
+
国内医院为单位的研究有大量撤稿,现在很多期刊编辑一看是“
miRNA/lncRNA+
国内医院为单位”的组合,下意识里就想拒稿,到现在还有很多文章在
PubPeer
上被质疑
。
我看了一下最近被质疑
miRNA
的研究有一个比较通用的问题:
很多研究的
miRNA
只在灵长类中才有,而在小鼠、大鼠这些平时大家用的比较多的模式物种里面根本就没有
,所以文章大概率是有问题的,有很多文章在被质疑后很快就撤稿了。其实这个问题是很普遍的,原因在于没有考虑物种的保守性,我记得
5
、
6
年前看很多人的本子就经常出现这个问题:
由于很多申请人关注的
lncRNA
是从动物模型中筛选出来的,还是在疾病模型中高表达并且已经验证了有功能,但是最后突然发现这个
lncRNA
居然在人里面不保守或者根本不表达,虽然从文章上来说还好,但是从基金申请来说临床意义一下就打折扣了
,这样就有很多本子被毙掉。
第二阶段:以
RNA
结合蛋白
RBP
为主要作用机制的研究
除了
miRNA
外,
RNA
结合蛋白
RBP
是大家研究
CircRNA
的另外一个常见机制。
由于
RNA
结合蛋白所参与的功能不同,实际上
CircRNA
发挥作用的方式差别也很大,
实际上作为
RNA