收藏｜GFF文件的所有操作均在这里

1.通过GFF文件获取序列信息

Python/3.4.3/bin/python write_fasta_from_gff.py -h

２．两个GFF文件比较输出一致的结果

Python/3.4.3/bin/python report_basic_gff_model_agreement.py -h

３．移除重复的注释信息

Python/3.4.3/bin/python remove_duplicate_features.py -h

４．根据特定ID提取GFF信息

Python/3.4.3/bin/python filter_gff3_by_id_list.py -h

５．NCBI提交数据所需要的tbl格式

Python/3.4.3/bin/python convert_gff3_to_ncbi_tbl.py -h

６．比较两个GFF文件，并输出特异性和敏感性

Python/3.4.3/bin/python compare_gene_structures.py -h

７．输出gene,mRNA,CDS,exon长度统计信息

Python/3.4.3/bin/python report_gff3_statistics.py -h

８．输出内含子和基因间区长度统计信息

Python/3.4.3/bin/python  report_gff_intron_and_intergenic_stats.py  -h

更多GFF操作工具如下，下载地址点击阅读原文即可．

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