肌联蛋白和膜蛋白数据库推荐

今天介绍的两个蛋白数据库一个是关于肌联蛋白的，另一个是关于膜蛋白的。

Titin(肌联蛋白)是目前已知的最大的蛋白质,它的分子量为2700kDa(25000多个氨基端)，根据IUPAC（国际理论和应用化学联合会）命名规则，该肌联蛋白的名字足足有189819个字母，是世界上字母量最大的单词，快速读完这个单词需要3个多小时，即读完它的全部25000个氨基酸名称~~~

肌联蛋白的数据库，TITINdb，http://fraternalilab.kcl.ac.uk/TITINdb/。该数据库的开发团队来自于神秘的King's College London，都是王的人，orz

肌联蛋白是骨骼肌纤维中第三类丰富蛋白质，结构也十分复杂，研究表明，其与胸腺瘤重症肌无力、心肌病以及肌肉相关的呼吸衰竭等多种疾病相关。

选择Search进行详细的搜索，右上角提供了蛋白质域的搜索。

详细搜索中我们可以根据同型氨基酸的位置、SNP位点的ID以及疾病类型进行检索：

（网页Tutorials原图）

比如我们搜索ARVC，得到下列结果，点击相应的Domain即可查看详细信息

随后点击这里即可进行可视化操作

显示gnomAD数据库来源的SNVs信息，不同的颜色表示SNVs的出现频率

而我们之前检索的ARVC相关的SNVs可视化结果如下，黄色表示它处于surface的位置，红色则表示buried。

膜蛋白数据库Membranome，http://membranome.org/是由美国密歇根大学的研究团队开发的数据库，包含了6个物种6039个单次跨膜蛋白（bitopic transmembrane proteins）的信息。该数据库提供了详细的膜蛋白分类，由于膜蛋白的功能十分复杂，所以系统的分类能够让我们更好地理解它们的生物学功能和作用。