今天小塔在浏览数据挖掘文献，发现了一篇发在Am J Kidney Dis（IF=13.2）的优秀文献，整体思路通透，简单易复现。
在进行公共临床数据库的数据挖掘时，有一些注意事项：
1、要重视数据的质量和数量。数据质量可能对结果产生显著影响，因此需要清洗和预处理数据，包括处理缺失值、异常值和不一致的值。
2、需要选择与研究对象和变量数据分布特征相匹配的数据挖掘方法，这可能需要尝试多种方法并进行比对与适当改进。在分析的过程中，需要注意数据的类型和特征，例如是否是分类变量、连续变量还是有序分类变量。
3，数据标准化和参数设定，在数据挖掘前，可能需要对数据格式进行转换和标准化。需要设定合适的参数，进行模型训练。
4、重视数据的隐私和安全：公共临床数据库的信息需要得到保护，特别是在数据传输和存储时。要采取措施保护个人隐私，遵守相关法律法规和伦理准则。
Ps：一定要记住这些重点哦~
作者用的是法国国家移植数据库（法国国家移植数据库是一个公共数据库。它由法国卫生部授权的器官捐献和移植管理机构运营，旨在提高器官捐献和移植的效率和安全性。该数据库收集并存储了法国各地的器官捐献和移植数据，包括器官类型、捐献者年龄、性别、健康状况、器官匹配程度、手术过程、手术后效果等信息）。进行了一项回顾性多中心队列研究，重点关注2008-2018年这段时间:所有在法国接受肾移植的AA淀粉样变性患者都被纳入其中。目的是描述队列(AA淀粉样变的原因，接受的治疗)，报告移植结果，并试图确定与患者和移植物存活相关的因素。全文贯穿的体现了刚才我们说的四个注意点。让我们一起来看看具体怎么分析吧~
（PS：如果你觉得大脑一片空白，不知道怎么搞创新的宝贝们，快来找小塔啊，一大波脑洞大开的思路正等着你来领取！让我们一起打开新世界的大门！）
题目：AA淀粉样变性患者的肾移植:法国多中心队列研究的结果
杂志：Am J Kidney Dis
影响因子：IF=13.2
发表时间：2023年9月
淀粉样变性以淀粉样蛋白的细胞外沉积为特征，淀粉样蛋白是一种不溶性纤维，由错误折叠的蛋白质在特定的β-薄片构象中积累而形成。沉积可发生在所有组织中，并导致进行性器官功能障碍。AA淀粉样变常累及肾脏，在迄今为止374例AA淀粉样变患者的最大系列中，44%的病例导致肾衰竭，是主要的预后因素。长期透析的AA淀粉样变性患者生存率较差。这些患者可考虑肾移植，但仍担心死亡率增加和移植物淀粉样变性复发的可能性。总的来说，关于AA淀粉样变性患者肾移植的研究较少，且具有异质性。此外，缺乏最近的数据，所有被引用的研究都有很长的纳入期。
首先设置及参与者，检索了法国国家移植数据库，以确定2008年至2018年期间接受肾移植的所有肾AA淀粉样变性患者。包括年龄，淀粉样变的原因，生物疗法的使用，CRP水平。死亡率的Kaplan-Meier估计和同种异体移植损失的累积发生率函数法。分别使用Cox比例风险模型和病因特异性风险模型调查与患者和同种异体移植物存活相关的因素。
患者的初始特征见表1。移植时的平均年龄为49.4(39.7-61.1)岁，平均体重指数为22.2 (20.0-24.3)kg/m2。3人(3.5%)既往患有糖尿病，45人(52.3%)既往患有高血压。肾活检47例(54.7%)，组织活检31例(36.0%);其余8例(9.3%)未发现AA淀粉样变的组织学证据(这些患者均为FMF患者，没有其他合理的肾病原因)。淀粉样变病因为:FMF(37例，43.0%);另一例自体炎症综合征(6例，7.0%);包括TNF受体相关周期性综合征(TRAPS)、高免疫球蛋白D综合征(HIDS)、施尼茨勒综合征和冷冻素相关周期性综合征(CAPS));慢性炎症性疾病(19例(22.1%)，包括克罗恩病(9例)、强直性脊柱炎(4例)、类风湿性关节炎(2例)、Castelman病(2例)、Rosai-Dorfman病(1例)以及克罗恩病与强直性脊柱炎的关联(1例);慢性感染(11例(12.8%)，包括结核分枝杆菌感染(5例)、支气管扩张(3例)、囊性纤维化、Hirschprung病合并慢性会阴脓肿和慢性骶骨压疮);其余13例(15.3%)AA型淀粉样变病因不明。
供体和移植器官的特征见表1。值得注意的是，有3例联合移植(分别为肝、心、肺)。移植时出现hla抗体的占44.2%，出现DSA的占11.6%。9名患者(10.5%)因先前的移植而接受过免疫抑制。免疫抑制方案为抗胸腺细胞球蛋白诱导41例(47.7%)，巴昔单抗诱导45例(53.3%);在随访期间，维持治疗包括:皮质类固醇(所有病例)，钙调磷酸酶抑制剂(所有病例:他克莫司74例(91.9%)，环孢素19例(22.1%))，霉酚酸酯(83例，96.5%)，硫唑嘌呤(11例，12.8%)，mTOR抑制剂(9例，10.5%)和迟来他肽(5例，5.8%)。此外，8名患者(9.3%)接受了利妥昔单抗治疗，作为部分或诱导治疗或急性排斥反应的治疗。中位随访时间为55.8（28.3-86.8）个月。随访共413.1人年。
图1A显示了患者的生存情况。随访期间共有17例患者死亡。移植后1年生存率为94.0%(95%可信区间(CI) 89.1-99.2)， 5年生存率为85.5% (95% CI 77.8-94.0)。死亡原因为感染(9例，52.9%)、心血管疾病(3例，17.6%)、癌症(1例，5.9%)和未知原因(4例，23.5%)。图1B显示了随访期间移植物丢失和死亡的累积发生率(作为竞争风险分析)。1年时，移植物丧失的累积发生率为10.5% (95% CI 4.0-17.0)， 5年时为13.0% (95% CI 5.8-20.1)。移植后1年全因移植失败16.3% (95% IC 4.9-27.8)， 5年全因移植失败24.2% (95% IC 9.9-38.3)。在功能正常的移植物中，移植后1年的中位eGFR为55 (41-68)ml/min/1.73m2, 5年的中位eGFR为45 (33-65)ml/min/1.73m2
