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RDA是
基于对应分析发展而来的一种排序方法，将对应分析与多元回归分析相结合，每一步计算均与环境因子进行回归，又称
多元直接梯度分析
。此分析是主要用来反映菌群与环境因子之间关系，可以检测
环境因子、样本、菌群
（抗性基因，KEGG功能）三者之间的关系或者两两之间的关系，可得到影响样品分布的重要环境驱动因子，因此，被广泛应用于微生物组的数据分析。
本文主要介绍一下如何利用
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进行RDA分析？下面给出RDA分析的详细步骤，快来学习一下吧！
一、导入丰度表和分组和环境因子表两个输入文件
输入文件为制表符分隔的文本文件表格，
丰度表
行名为
组学feature名
(如微生物，代谢物，基因，表型名)，列名为
样本名
，唯一 (不可重复)；分组和环境因子表的行名为样本名（与丰度表列名相对应，顺序可以不一样），列名为
分组方案
和
环境因子名
。
二、选定分组方案
三、选定分组对应的颜色
可选择
默认值
，也可以按照
个人需要
进行调整
颜色
及
明亮
程度，示例如下：
四、选定热图中的feature个数上限
选择不同feature个数，可对丰度最高的feature画图，feature个数一般选择
默认值
即可，或按照
个人需要
进行调整。
五、提交任务
点击
提交任务
，可选择任务完成时发邮件提醒，可避免等待运行时间，运行结束后可预览结果图，并下载结果文件。
结果展示
图中每个点代表一个物种，点越大，对应
物种丰度越高
，点之间的距离代表
群落结构差异程度
；箭头表示环境因子，箭头长度代表某个环境因子与群落分布相关程度的大小，箭头越长说明
相关性越大
；物种与环境因子之间的夹角代表
物种与环境因子之间的正负相关性
（正相关时为锐角，负相关时为钝角，直角无相关性）。
还有不懂的话，不妨打开我们下方的
视频讲解
，深入学习一下吧！
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