应用网络药理学和生物信息学技术研究中药复方/单体作用机制的学习班
玮瑜主办 2017年7月29日-30日（周六日）上海
课程简介
中药复方以及中药单体配伍制剂是现代中医治疗疾病的主要方式，它通过潜在的成分-靶点相互作用来治疗各种疾病，在降低不良反应的同时最大化治疗效果。然而，由于中药的成份多、作用机制复杂的特点造成了中药作用机理的不明确，研究难度大，尤其是在SCI论文发表过程中无法获得认可和支撑。
近年来，随着网络药理学和生物信息学的发展，将生物信息学技术和网络药理学方法相糅合，联合实验验证成为中药复方机制研究中的重要方式之一，在SCI论文发表方面获得了新的进展。基于该模式的中药复方研究打破了传统的中药复方机制研究的瓶颈，使得原先难以定性的机制得以预测和验证。该研究方法适用于各类病症的中药复方/单体治疗机制研究，现已成功应用于多篇SCI（IF＞5）论文的使用和发表。与此同时，中药单体和复方的研究成为近年来研究的热点和国自然基金重点扶持的领域，作为临床医生、科研人员和硕博士研究生，尤其是没有生物信息学分析基础和网络药理学基础的初学者，在面对错综复杂的数据时，难免会无从下手，遇到一个小小的技术难点总会卡住很久，研究进度十分缓慢。不知道如何去解析一个中药复方的作用机制，如何去挖掘成分-靶点之间的关系，如何将药物作用机制和疾病机制相关联？如何利用免费的数据挖掘，为自己的中药复方研究增添亮点？如何利用生物信息学技术，解析中药复方作用机制？
本次学习班将带领广大学员，共同学习将网络药理学和生物信息学相结合的中药复方研究思路，轻松突破中药复方SCI文章的5分魔咒。现场实战教学，带领学员解析中药复方作用机制，学员也可以将自己研究的复方带来学习班，利用课间时间解析中药复方作用机制。
课程内容、目标与特色
本次学习班课程严格按照中药复方解析的顺序设计，层层递进，逐步挖掘中药复方的作用机制。将讲述如何利用VBA工具检索复方成分并使用ADME参数筛选有效成分；如何利用VBA工具检索成分靶点；如何使用药效团靶点预测工具开展中药单体成分的机制研究；如何使用Cytoscape构建网络和进行网络拓扑分析，以及多种插件的灵活使用；讲述如何将GEO数据库和Connectivity Map数据库应用于中药复方的机制研究；如何利用Cytoscape构建多数据库来源的蛋白质相互作用网络；如何利用MCODE算法筛选网络核心模块；如何利用简单在线工具进行富集分析和富集散点图、文恩图的绘制。
本次学习班全程电脑实战教学，90%以上为上机指导操作，无繁琐的理论授课，做到课程学完，就能独立解析中药复方，分析复方治疗疾病的潜在分子机制，并进行后续的实验验证研究提供指导。
授课老师
本次主讲老师成功将网络药理学和生物信息学技术相结合，应用于中药复方的机制研究，发表和参与发表多篇5分以上的中药复方机制研究的文章。
适合对象：
各级医院临床医生、药师、科研单位研究人员、高校硕/博士研究生、对中药复方和网络药理学感兴趣的广大师生（尤其适合初学者和无基础的学员，无需任何基础，也无需学习任何R语言，轻松解析中药复方）
课程设置
第一天上午：中药复方有效成分的筛选、靶点预测和分析
1. 中药复方网络药理学和生物信息学结合的SCI文章套路学习
2. 中药有效成分的查找和基于ADME参数的成分筛选（包括使用VBA工具快速获取中药成分信息数据，上机实战）
3. 中药有效成分对应靶点的获取、整理和基因名转换（包括使用VBA工具快速获取成分-靶点关系数据，上机实战）
4. 基于药效团模型的中药单成分/化合物的靶点预测（包括PubChem数据库的简单使用和成分3D结构文件的下载，上机实战）
第一天下午：疾病相关靶点的检索和生物信息学技术在中药复方中的应用
1. 基于网络药理学的分子对接靶点验证（快速分子对接，单个成分多个靶点对接或者多个成分多个靶点对接，简单易学，适合初学者，发文章够用，上机实战）
2. 疾病相关靶点的检索和获取（通过多个数据库联合检索疾病相关的已知靶点，实战演示）
3. GEO数据库分析和获取特定疾病靶点（包括GEO数据库的简单介绍，GEO芯片的在线分析和利用在线工具进行GEO芯片的分析，绘制热图，非常适合没有R语言基础的初学者，上机实战）
4. 利用文本挖掘工具检索疾病相关靶点，增加疾病靶点可靠性。
5. 基于ConnectivityMap的中药复方或单成分的机制研究，以及相关耐药研究的思路探讨。
第二天上午：成分靶点网络构建和Cytoscape详细使用
1. 多种方式绘制文恩图，交集分析。包括在线工具、软件等方式，最多支持6组的文恩图分析，无需任何R语言基础，上机实战。
2. 成分-靶点网络构建过程中数据文件的编排以及网络绘图的注意事项，上机实战
3. Cytoscape软件以及相关插件的详细使用（包括中药复方成分-靶点网络绘制、网络美化和调整、交集网络构建、子网络提取构建、图片导出和数据导出等，上机实战）
第二天下午：中药复方作用机制分析和其他分析手段拓展
1. 常用蛋白质相互作用关系数据库的介绍以及使用Cytoscape插件快速构建蛋白质相互作用关系网络，并使用拓扑分析和MCODE分析，寻找蛋白质相互作用网络中的关键节点，构建子网络，上机实战。
2. 基于DAVID的靶点GO注释分析和KEGG信号通路分析，以及利用在线工具绘制富集散点图，利用Bingo、GlueGO等Cytoscape插件进行富集分析和结果绘图，上机实战。
3. 常用网址的使用和简单教学（包括简单的miRNA靶基因预测、文本算法挖掘工具简单教学等，根据时间安排，上机实战）
备注：自带笔记本电脑，安装WINDOWS操作系统，需要安装Cytoscape3.2.1（需要安装java，具体插件报名后告知如何安装）、OfficeExcel 2010等软件。
主办单位
上海玮瑜生物科技有限公司
时间地点
会务时间：2017年7月29日-30日 28日报到 会务地点：田林宾馆（上海田林路1号）
住宿：（没有强行规定，可以自订酒店，住宿费用自理）
田林宾馆，标准间（含早）380元/人、合住190元/人，费用自理。合住的学员最后出现单人无法安排的情况，需要自补房间差价。
注册费用：
2400元/人。授课期间发放纸质邀请函（盖章）和发票。按交费先后顺序确定座位号。会务期间提供午餐，晚餐自理。
付款方式：
1，转账或支付宝：您可以按照下面的指定账号放心汇款，汇款前您也可以和招生老师核对账户
2，现场刷卡或现金：您也可以现场刷卡和支付现金。
A：汇款账户
账户名称：上海服淡信息科技有限公司 账户号：31578103002581719
开户行：上海银行桃浦支行
B：支付宝转账
收款人：[email protected] 户 名:上海玮瑜生物科技有限公司
汇款时写上您的姓名，如果朋友代付一定要注明您本人的名字，便于好查询。
疑问咨询：
联系人：谢老师13611825136 报名邮箱： [email protected]
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