宏基因组与代谢组学
R
语言分析及可视化实操研讨会
2022
年11月26日
腾讯会议网络会议室
【背景介绍】
微生物是自然界中分布最广、种类最多、数量最大的生物类群。以肠道微生物为例，人体内微生物的总数量约是人体细胞总数的10倍 —— 越来越多的研究发现，肠道微生物与人体健康有着密切的关系，而微生物产生的代谢物是调控过程中最主要的中间递质之一。
宏基因组研究
包括
16s
测序和宏基因组测序，可以获得微生物群落丰度以及组成。通过分析可以获得关键菌群以及功能，为疾病治疗提供研究基础。
代谢组学
是基于LC-MS/MS液质联用技术对生物样本中的小分子代谢物进行定性和相对定量分析。
宏基因组
-
代谢组的联合分析
能够从多个维度阐释一个科学问题，可以用来解释差异菌群与差异代谢物的关联性，从而帮助建立微生物-代谢物-表型之间的逻辑关系。
基于以上原因，医药加推出
“
宏基因组
+
代谢组联合分析
”
R软件实操课程，带您充分挖掘数据，掌握生信高级分析能力。
【主要内容】
详细内容见下文日程表
1.宏基因组生信文章解读与报告解读；
2.R和Rstudio软件安装，宏基因组与代谢组学联合分析实操；
3.生信SCI文章实用数据处理与图片导出。
【会议预期】
通过一天的时间学习数据处理分析及可视化作图，得到SCI水平的图片。
【讲师简介】
宋伟
博士
成果：
参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请；肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建；完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。
研究方向：
有近十年的生信分析经验，擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等，精通perl、R等编程语言。
培训经历：
在上海、北京、广州、沈阳、南京等城市举办过几十场现场培训班。
主办方：
上海循掘生物科技中心
会议时间
：
2022年11月26日
会议地点
：线上：
腾讯会议网络会议室
收费标准：
会务费：
线上：
1500元/人；
优惠政策：
1.
提前
确认报名及转账的，可以提前拿到学习材料
2.三人组团报名，每人优惠100元
3.四人组团报名，每人优惠200元，
4.六人组团报名缴费，可免1人会务费！
可以开正规会务发票，纸质邀请函（盖红章）。
注意事项：必须携带win10以上系统的电脑，现场不得录音录像。上课软件为R和Rstudio。
报名方式：
报名请识别二维码添加小编微信
朱老师：18117064991
【会议日程】
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宏基因组与代谢组学
R
语言分析及可视化会议日程
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时间安排
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课程表
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介绍
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上午
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9:00 -10:15
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生信分析思路及测序标准报告解读
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1.
生信简介；
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2.
宏基因组生信文献解读；
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3.
宏基因组与其他组学整合文献解读；
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4.
16s
测序分析报告解读；
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5.
宏基因组测序分析报告解读；
6.
代谢组分析报告解读；
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10:30-12:00
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R
语言基础
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7.
R
软件与
Rstudio
软件安装；
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8.
R
基础
—
类与对象（元素、向量、矩阵）；
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9.
R
基础
—
函数；
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10.
R
基础
—
路径
修改、文件导入、导出图表；
11. R基础—R包及安装
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下午
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13:30 -15:15
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宏基因组及代谢组数据生信分析
R
实操演示
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12.
α
多样性箱线图；
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13.
β
多样性
PCoA
分析；
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14.
物种组成柱状图；
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15.
物种热图分析
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16.
LeFse
分析树形图分析。
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17.
无监督
PCA
分析；
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18.
PLS/DA
分析
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19.
Limma
差异分析计算
logFC
与
p
值；
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20.
火山图与差异基因热图；
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21.
功能气泡图；
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22.
16s
与代谢组整合共表达分析；
23
. 桑基图分析。
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15:30 - 17:15
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数据库及在线工具实操
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24.
Venn
图在线工具；
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25.
KEGG
数据库；
26
. metaboAnalyst
数据库；
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17:15- 17:30
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答疑
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示例图展示
