据麦姆斯咨询报道,麻省理工学院(以下简称MIT)新设计了一个开源网站,将有可能成为微流控领域的Pinterest(一款图片分享社交应用)。开源网站的网址为Metafluidics.org,这是一个芯片实验室器件的免费设计库,各种发明人在网站上提交他们的设计,包括训练有素的科学家和工程师、爱好者、学生,以及业余制作者。该网站可共用户浏览的微流控器件,包括从简单的细胞分选器和流体混合器,到更复杂的用于分析眼液和合成基因序列的芯片。该网站也可以作为一个微流控社区的社交平台,任何用户都可以登录并提交设计,也可以点赞、评论、下载设计文件来重现特色器件或对其进行改进。
MIT媒体实验室的新社区生物技术计划主任David S. Kong表示,新网站的建设是为了加速微流控设计的创新,打破微流控所遵循的传统、学术性的同行评议路线。
Kong指出,“对微流控业内人士而言,常常会遇到这种情况,有时候你会在一篇非常不错的论文中看到一款微流控设计,但当你想要试图重现这款器件设计时,你会发现重现或重组这款器件的关键设计部分,并没有系统性地分享出来。因此,世界各地的研究人员很多情况下都在进行重复工作,这就是为什么一般来说开源能够成为非常重要原则的原因之一,开源能真正加快技术的传播。”
Kong和他的同事在上周发表在《自然生物技术》(Nature Biotechnology)杂志的论文中介绍了这个开源平台。他的共同撰稿人包括来自MIT林肯实验室(Lincoln Laboratory)的Todd Thorsen、Peter Carr、Scott Wick,生物工程部门的Jonathan Babb、Jeremy Gam,生物工程、电机工程与计算机科学学院教授Ron Weiss。
一个开放的生态系统
研究人员模仿时下流行的开源资源库,如GitHub(一个承载开源软件项目的免费网站)和Thingiverse(为用户创建玩具、小工具和机器人提供硬件设计文件的网站),建立了Metafluidics网站。
Kong在林肯实验室当合成生物学家时,就提出了建设Metafluidics的想法,他当时正在研究DNA片段重组,将新的功能植入活体细胞中。为此,他经常使用DNA资料库,如美国国家卫生研究院(National Institutes of Health)的基因库(GenBank),这是一个公开的数据库,科学家们可以通过这些数据共享并访问基因序列及其它相关功能。
“合成生物学领域有很多不同类型的信息可以共享,”Kong评价道,“因此,生物技术领域更大范围的开源运动非常有必要,我们希望能够填补该生态系统很重要的与硬件相关部分。”
策划
该团队与开源软件咨询公司Bocoup合作,推出共享微流控设计的开源平台。用户如需访问免费网站,只需要填写一个简短的个人简介就能登录,之后就可以浏览精选器件或搜索该网站以获取特定的微流控功能。
每一个上传到网站上的器件都包含简要说明,以及用于制造芯片的材料列表和相关设计文件,如计算机辅助设计(computer-aided-design, CAD)图纸。
Kong 说道,“纸基微流控、3D打印和软刻蚀芯片,这些技术都需要数字设计文件,这是我们首次向更大的社区提供这些关键信息。”
该网站目前已经有学生和业余爱好者提交设计,微流控领域的领先专家Thorsen也贡献了几个之前发表过,已经被高度引用的器件,以及重现它们的蓝图。
Kong继续说道,“我们正在接触更广泛领域的主要先驱和领导者,并策划将他们的设计文件做成合集。希望我们的努力能够为大家带来灵感制造出新一代微流控器件。”
该网站由编辑团队管理,管理人员包括Nina Wang(MIT生物工程大二学生)和Kong(目前正在努力提高微流控群体对该开源网站的认知)。最终,随着人们上传更多的器件,团队计划突出某些特定的设计,例如,策划一个“本周部分”。
Kong 表示,“随着时间的推移,我们也将发起挑战:谁能做出最快的粒子分选机?谁能制造出培养某种肠道微生物的器件?就我个人观点而言,当不同的群体参与进来,并且贡献大量的开源设计时,创新就会变成一个整体并从中受益。”
一个民主的微流控环境