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现在,全合成还能培养药物化学家吗?

化学空间 服务科研工作者  · 公众号  ·  · 2024-08-19 09:00

正文


现在,全合成还能培养药物化学家吗?






译自Chem-Station网站日本版 原文链接:全合成研究は創薬化学のトレーニングになり得るか?


翻译:炸鸡


2024年1月,ACS Medicinal Chemistry Letters 期刊发布了一篇以” 天然物全合成至今仍然是创药化学(医药化学)一个很好的训练课程 “为主题的观点论文,2024年6月该篇论文当选为 ACS Medicinal Chemistry Letters 的Most Read Article。


Total Synthesis as Training for Medicinal Chemistry

Lewis D. Pennington

ACS Med. Chem. Lett. 2024, 15 , 2 , 156–158, DOI: 10.1021/acsmedchemlett.3c00556


论文作者 Lewis D. Pennington 现担任Mystic River Medicinal Chemistry, LLC的顾问,在美国拥有18项专利,WO申请专利37件,参与了两种已进入临床试验药物的研发。从2003年至2015年在Amgen工作。


全合成和创药化学


在有机合成化学大类中,全合成是一项通过设计天然物的合成路径并找到最合适的合成路径,从而以较高收率得到目的物的一个热门的研究分支。学习全合成不仅要学习有机合成,还要学习如何确定分子结构,有时还要涉猎分子的生理活性研究,进一步还会设计新反应的开发,可以说是一个需要学习很多知识的研究分支。


当今的药物化学家要面对的是极具挑战性的治疗靶向,还有迅速优化各类参数以及功能交叉 (cross-functional)性质的需要,所以仅仅是合成领域的知识无法满足现代药物化学家们的需求,现代药物化学家需要的是交叉领域的知识。此外,药物化学也涉及核酸、肽类、抗体-药物偶联物(Antibody-drug conjugate,简称为ADC)等新型药物形式的开发,但另一方面,有人指出在制药行业相较于全合成,化学生物学和计算化学的训练可能更为有益。当下AI创药是大势所趋,在这样的背景下全合成能够持续为现代创药化学创造出价值吗?


作为本文作者的我对以上疑问的回答是「 YES 」,笔者还相信作为药物化学家训练营的全合成的学习含金量今后还会不断地”升值”。


在现代药物化学,特别是小分子药物研发中,结构的新颖性和分子的复杂性不断增加,而以天然物为基础的药物依然是小分子到中分子药物的模板。此外,正如Fsp 3 这一参数所代表的那样,类似天然物的低平面性和高柔性的分子在药物研发中可能具有较高的成功概率,因此,从全合成中可以学到很多东西。


全合成和创药化学的相似性


论文的Figure 1向我们展示了全合成和低分子创药化学各自的研究循环的对比图(下图)。








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