专栏名称: 生信媛
生信媛,从1人分享,到8人同行。坚持分享生信入门方法与课程,持续记录生信相关的分析pipeline, python和R在生物信息学中的利用。内容涵盖服务器使用、基因组转录组分析以及群体遗传。
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有了它,超大文本文件打开不再怕

生信媛  · 公众号  · 生物  · 2019-12-17 06:00

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eGPS下载地址: http://www.egps-software.org/

QQ group: 550899355

如果GIF难以观看或者观看费劲,请移步 bilibili 观看。可直接搜索 eGPS 或者 https://space.bilibili.com/479371629/channel/detail?cid=92544


说明

我们的eGPS作为一个大型软件,现在终于有了自己的编辑器。而且不是一个简单的编辑器。

对于生物数据而言,单个文件经常会超过1个G。很多时候我就想看看里面的内容,奈何一拖进软件就因为文件太大而没有了响应。

现在我们有了eGPS的Editor模块,理论上任何文本文件都可以由我们来查看。例如我们现在拖入一个10个G的VCF格式的文件,注意它是10个G!然后拖入eGPS,界面如下图所示。

初次进入模块界面

等建立完索引,我们可以正常的查看大型文件。

不仅仅如此

我们的Text editor还支持编辑操作,编辑完之后还可以保存更改。编辑操作包括,复制、剪切、粘贴、删除、撤销、更改等,还支持全局替换和文件行号的跳转。

例如我们再试一个1.6个G的fasta文本文件,我们可以很丝滑地拖动到最后的两千多万行。

入群优势

入群拥有提前体验新模块的优势。加入QQ群可以提前体验到新的功能模块,这次是一个桑基图:可以表示基因之间的互作。

eGPS 下载地址:http://www.egps-software.org/QQ group: 550899355







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