专栏名称: BioArt
BioArt致力于分享生命科学领域科研学术背后鲜为人知的故事,及时报道和评论生命科学领域有料的动态,BioArt也是一个生命科学领域“百花齐放,百家争鸣”的舞台,循“自由之思想”与“独立之精神”为往圣继绝学。
51好读  ›  专栏  ›  BioArt

Cell | 国际空间站的微生物与化学物质全景

BioArt  · 公众号  · 生物  · 2025-03-20 17:00

正文

撰文 | 易


人类迈向太空探索的步伐越来越快,未来的目标不仅仅是短暂驻留,而是长期居住,甚至殖民其他星球。然而,太空居住环境与地球上的建筑环境截然不同,它不仅完全与外界隔绝,而且长期处于微重力、高辐射和密闭的生态系统之中。这种极端环境对宇航员的健康、舱内设施的维护以及微生物群落的演变都带来了前所未有的挑战。


相比地球,太空环境带来了全新的生存压力。首先,微重力影响流体动力学,改变了微生物的附着和传播模式。其次, 国际空间站 ISS 暴露在高强度的宇宙辐射中,这可能导致微生物的突变,使其生存策略发生变化。此外,密闭环境使得微生物能够长期停留在特定表面上,形成生物膜,甚至影响宇航员的健康。而且,在有限资源的情况下,ISS 内部的有机物、清洁剂、人体代谢物等都可能成为微生物的潜在养分来源。过去的研究表明,ISS 中的微生物群落与地球上的有显著差异。某些耐受极端环境的菌株可能在 ISS 内部生存时间更长,并表现出更高的抗生素耐受性。例如,金黄色葡萄球菌和伯克氏菌可能在 ISS 内部形成稳定种群。此外,某些微生物可能对设备材料造成腐蚀,影响空间站的长期运行。除了微生物,ISS 还充满了各种化学物质。这些化学成分可能来自宇航员代谢 (如汗液、尿液、皮脂分泌物) 、食物残留 (如咖啡因、香料、人工甜味剂) 、清洁剂和消毒剂 (如季铵盐、表面活性剂) ,以及设备材料释放的化学物质 (如塑料添加剂、橡胶防腐剂)


在太空,所有微生物的来源都被严格限定,主要来自宇航员自身、补给物资以及舱内循环系统。这些微生物在空间站内如何分布?它们如何与环境中的化学物质相互作用?它们是否会影响宇航员的健康,甚至改变舱内材料的稳定性?这些问题至今尚未完全解答。


近日,加州大学 Rob Knight Pieter C. Dorrestein 联合在 Cell 期刊上发表题为 The International Space Station has a unique and extreme microbial and chemical environment driven by use patterns 的研究文章, 在国际空间站(ISS)美国轨道舱段进行了大规模的采样和分析,绘制出 ISS 内部微生物与代谢物的“三维生态地图”,揭示不同舱段的微生物生态特征,并探索 ISS 是否可以被视为人造环境微生物演变的极端案例。



为了全面剖析ISS内的微生物和化学物质分布,作者在空间站运行期间进行了广泛采样,收集了803份样本,涵盖了ISS内9个主要舱段。采用了一种多层次的综合分析策略,结合基因组学、代谢组学和三维建模,以获得ISS生态系统的完整信息。


首先,作者利用SourceTracker2生物信息学工具追踪ISS采样表面的微生物群落来源,并结合16S rRNA基因测序分析ISS内的微生物种类和丰度,以探测可能的致病菌或特殊耐受菌。研究发现,ISS内的微生物主要来源于宇航员的皮肤、鼻腔和肠道。例如,金黄色葡萄球菌 (Staphylococcus aureus) 99.2%来源于皮肤,97.8%来源于鼻腔。此外,肠道细菌 (如肠球菌、拟杆菌) 主要出现在 Node 3 (卫生间模块) ,表明粪便传播是微生物扩散的重要途径。虽然部分微生物可能通过空气传播,但其贡献远远小于人体来源。这些结果表明宇航员是ISS微生物的最大贡献者。


其次,为了分析ISS内部的化学物质,使用LC-MS/MS (液相色谱-质谱联用) 进行非靶向代谢组学分析,从ISS采样表面提取化学成分,并与多个化学数据库比对 (如食品数据库、微生物代谢数据库、环境污染物数据库) ,识别代谢物、清洁剂成分、塑料添加剂及其他潜在的污染物。检测到10,961种不同的化学物质,主要包括食物残留 (如胡椒碱、柑橘黄酮、咖啡因、人工甜味剂) 、人体代谢物 (如尿酸、苯乙酰谷氨酰胺、吲哚硫酸) 、工业化学品 (如邻苯二甲酸酯、聚乙二醇表面活性剂、橡胶防腐剂) 以及清洁剂和消毒剂 (如季铵盐、过氧化氢) 。其中,Node 3 (卫生间 + 健身区) 具有最多的特异性化学物质 (149种) ,与尿液、汗液和清洁剂密切相关。


最后,采用 ili 100 三维建模工具构建ISS各个舱段的微生物-化学分布图,分析其空间分布模式,从而更直观地展示ISS内部生态系统的复杂性。大约31%的化学物质在微生物培养数据库中有对应的代谢能力,提示某些微生物可能以ISS表面化学物质为“养料”。其中,厚壁菌门 Firmicutes 和放线菌门 Actinobacteriota 的某些成员在ISS内部富集,可能与特定化学物质的降解有关。此外,微生物多样性和化学多样性呈正相关,表明化学环境可能影响ISS的微生物群落。



总而言之 ,这项研究不仅绘制了ISS内部的微生物-化学生态全景图,还揭示了太空环境对微生物群落的深远影响。ISS是地球工业化环境的极端例子,它的微生物群落不仅受到宇航员活动的强烈影响,也反映了太空居住环境的特殊挑战。


原文链接:

https://doi.org/10.1016/j.cell.2025.01.039


制版人: 十一


学术合作组织

(*排名不分先后)


战略合作伙伴

(*排名不分先后)

(*排名不分先后)

·






请到「今天看啥」查看全文