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【DeepSeek专栏】Mol Cell | 整合应激反应调控18s非功能性rRNA降解

BioArt  · 公众号  · 生物  · 2025-02-18 17:30

正文

温馨提示: 本文由DeepSeek生成初稿后经科学编辑加工修改所成,请读者注意甄别科学细节!

核糖体是细胞中负责蛋白质合成的核心分子机器,其功能完整性对维持细胞稳态至关重要。在酵母等模式生物中,当核糖体的rRNA (如18S或25S rRNA) 因突变导致功能异常时,细胞会通过“非功能性rRNA降解 (NRD) ”途径识别并清除这些缺陷核糖体。然而,哺乳动物中NRD的分子机制长期未被阐明。此外,细胞在应对压力时激活的“ 整合应激反应 ISR ”通过磷酸化翻译起始因子elF2α抑制全局蛋白质合成,但其在核糖体质量控制中的潜在作用尚不明确。

2025年2月12日,美国NIH的 Colin Chih-Chien Wu 团队在 Molecular Cell 上发表了文章 The integrated stress response regulates 18S nonfunctional rRNA decay in mammals 揭示了哺乳动物中18S非功能性rRNA降解的调控机制,并探索ISR在这一过程中的关键角色。



研究团队首先构建了一个正交的人类18S rRNA表达系统,通过引入突变 (如A1824C) 模拟解码中心的功能缺陷。实验发现,携带A1824C突变的18S rRNA虽然能组装成成熟的核糖体,但会导致核糖体在翻译起始阶段 (尤其是起始密码子处) 停滞。这种 停滞的核糖体激活了ISR的核心激酶GCN2,触发elF2α磷酸化,从而减少新翻译起始事件,避免扫描中的43S前起始复合物与停滞核糖体发生碰撞。

通过全基因组CRISPR筛选,研究者鉴定出GCN2及其辅因子GCN1、泛素连接酶RNF10和非典型激酶RIOK3是18S NRD的关键调控因子。进一步实验表明,GCN2的激活依赖于核糖体P-stalk结构,并通过磷酸化elF2α形成负反馈环路,将翻译起始水平维持在“最佳区间”——过高或过低的起始均会阻碍NRD效率。在GCN2缺陷的细胞中,翻译起始不受控导致43S复合物与停滞核糖体频繁碰撞,阻碍RNF10对缺陷核糖体的泛素化标记。

RNF10通过泛素化40S亚基的uS3和uS5蛋白,标记停滞核糖体以启动降解。质谱分析发现,RIOK3特异性结合泛素化的40S亚基,其泛素结合域 (UIM) 和激酶活性对18S rRNA的降解不可或缺。纳米孔测序显示,18S rRNA的降解起始于5'端、中心区和3'小域的多处切割,最终通过核糖核酸酶完成清除。

总之,本研究 首次在哺乳动物中揭示了18S非功能性rRNA降解的完整通路:缺陷核糖体通过GCN2激活ISR,限制翻译起始以避免碰撞,同时RNF10泛素化标记停滞核糖体,RIOK3则识别泛素信号并启动rRNA降解。 这一机制形成了动态反馈调控,确保细胞在压力条件下优先清除功能异常的核糖体,维持翻译系统的精确性。

该发现不仅扩展了对核糖体质量控制机制的理解,还建立了ISR在监控翻译起始质量中的新功能,为相关疾病 (如神经退行性疾病和癌症) 中核糖体功能异常的研究提供了新视角。未来研究可进一步解析RIOK3激酶活性的具体作用及降解过程中的核酸酶组分,为靶向核糖体质量控制的治疗策略奠定基础。



原文链接:
https://doi.org/10.1016/j.molcel.2025.01.017

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