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关注挑圈联靠,生信全知道。小白生信作图,看挑圈联靠;不会写R代码,看挑圈联靠;数据库不会用,看挑圈联靠。
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无需R语言!单基因肿瘤生信分析套路,0代码10分钟就可以搞定!(小白速看)

挑圈联靠  · 公众号  ·  · 2024-07-27 17:00

正文

你还在为没有生信基础而发愁吗? 你还在为文章复现不出来而苦恼吗? 你还在为不会代码而担忧吗?
其实, 只要学会了单基因套路,你将能够解决以上所有问题!
在生信研究领域,单基因分析是最经典且基本的研究套路之一,也是学握生信研究底层规律的关键。 学习单基因分析方法,能够快速入门生信领域,并为未来更复杂的生信研究打下坚实的基础。
因套路有以下优势:
优势一: 满足生信发文的最简配置
优势二: 可迁移性高
优势三: 上手快
优势四: 兼容性强
单基因文章的优势在于其相对简单的分析方法和套路,使得初学者可以轻松上手,保证了高产出和研究进展。
然而, 这并不意味着单基因文章缺乏创新性 。相反,通过在单基因套路上的创新和发掘,你可以使文章更具亮点和吸引力,进而提升文章的质量和影响力。
总之, 单基因套路是生信研究中一把利器 ,无论你的目标是发表高分论文还是批量发表低分论文,学会并善于运用单基因套路都将为你的生信研究带来很大的帮助。
大部分单基因套路的文章都涉及一些常见的分析方法,而 仙桃学术能够解决90%以上的问题 ,剩下的10%也基本上可以通过数据库等其他工具来解决。
选择了正确的工具,即使你是生信零基础、代码零基础,也能够迅速上手文章的复现甚至最终独立完成发文。
在本次 【用对工具,零代码也可以发3+SCI】免费课程 中, 讲师会使用仙桃学术工具,实操演示零代码复现一篇4分+单基因肿瘤文章,手把手带大家入门生信研究!

课程目录

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免费 学习用仙桃工具

零代码发3+SCI


01



挑圈联靠——生信分析思路

#

在生信领域,数据分析已成为研究的核心部分,而这一过程往往遵循着一套相对固定的模式,即“挑圈联靠”。

挑——表达差异

“挑”指的是从海量的生物学数据中挑选出合适的数据集进行分析。常用的数据源包括肿瘤样本的TCGA数据库和非肿瘤样本的GEO数据库。

在这一阶段,研究者通常会生成包括热图、火山图和韦恩图等在内的多种数据可视化图表,这些图表可展示基因表达的差异性和样本间的共表达情况。

进阶一些的分析方法,如PCA图和聚类树状图,可以帮助研究者进一步理解样本间的关系和分类。


圈——功能聚类

“圈”则涉及到对选定的基因或蛋白进行功能注释和通路分析,主要的分析手段有GEO和KEGG分析。 这些分析可以通过柱状图、气泡图等形式呈现。不同的工具和R语言包可以帮助实现各种数据可视化形式。




联——交互网络


“联”主要指构建分子之间的网络关系,如蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。针对与免疫相关的分子,可以进行免疫浸润分析,并通过棒棒糖图、分组对比图和散点图等形式进行展示,揭示肿瘤微环境和免疫细胞之间的复杂交互关系。





靠——临床意义

“靠”则是将分析结果与临床数据相结合,评估基因或蛋白的临床意义。这包括单因素和多因素分析,以及通过Cox回归分析评估预后因素。

更高级的分析包括Lasso回归用于构建预后模型,以及使用ROC曲线和KM生存曲线评估生存预后,这两个图是最低阶一旦涉及到临床意义最优先考虑的。



02



仙桃学术——零代码发生信

#


仙桃学术生信分析模块 已经按照“挑圈联靠”分好了类 ,搭配绘图功能,能实现一键出图,可以短时间内完成一篇完整的生信文章,而且还提供在线数据集的使用,完全不需要自行寻找数据集进行数据整理分析。




03



实操演示0代码复现生信文章

#

接下来,课程讲师会以一篇0代码可复现的生信文章为例,介绍文章思路,解读图表。


这篇4.2分研究子宫内膜癌的文章,使用了多个公共数据库进行差异分析和富集分析,最后使用仙桃学术进行预后模型的构建。



04



重点图表复现解读

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课程第二天,讲师会教大家如何使用仙桃和一些公共数据库对重点图表进行复现。 通过讲师的实操演示,你可以一步步跟随,轻松掌握用仙桃学术零代码作图。


· 三大课程亮点







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