自从Alpha Go成了围棋界的No.1，“智能”的潜力被广而周知，尤其对于大量的重复性工作，写个“算法”让电脑“跑”，得出的结果说不定比人强。
科学家不仅有足够大的脑洞，还有着非凡的执行力。这次是生物学者，他们借鉴了信息学科的思维，发明了基因测序的新方法。日前，一篇名为《基于信息理论来修正错误的高准确度荧光产生DNA测序方法》的论文在《自然·生物技术》上在线发表。研究者来自北京大学黄岩谊教授带领的团队。
“这个设计很巧妙，”东南大学教授陆祖宏说，“或许在信息科学里是‘小伎俩’，但在生物学研究中是一种思维方式的突破，而且奏效了。”
测序精准是“王道”
和体育界的“更快、更高、更远”类似，基因测序界的“金标准”是“更快、更长、更正确、还不贵”。
大名鼎鼎的“人类基因组计划”基于1代测序技术，耗时十余年测出一套完整的人类基因组密码，而利用现有的2代测序技术，这个时间可以缩短到半天内。
“2代测序技术，又叫高通量测序技术，”陆祖宏介绍，它能够在一个生物芯片上一次完成上亿个反应。“每个反应一次测定一个碱基。”
生物芯片上的反应单元非常小，几平方微米的芯片上会包含1000个待测DNA单链分子，在DNA聚合酶（促成单个碱基聚合）的作用下，单个碱基会按照配对规律合成已有DNA分子的互补链，每次合成一个，同时释放出荧光。不同的碱基（A、T、C、G）带有不同的荧光，检测到荧光的不同就能判断是什么碱基，进而读取DNA。
然而，每个单元中1000个分子的合成很难同步，“这个分子合成到99个时，那个分子可能合成到101个，这样捕捉到的荧光波长将会有所差异，可信度显着下降，”陆祖宏说，因此，2代基因测序仪的单次“读长”目前的极限在200个碱基对（bp）。通过DNA二端测序能做到400个bp，但很难进一步提高。读得越长，测得序列的正确性就会越低。
在人体基因测序领域，这是一对相差悬殊的数字：30亿、200。前者是人类基因组的碱基对数量，后者是目前测序准确度最高（99%）的2代基因测序仪的单次“读长”。可见以200为单位完成目标DNA的测序，不可避免会造成大量的误差。
测序技术正在向着满足“金标准”的路上不断推进，而此次我国学者发表的ECC（纠错编码）测序法正是对现有手段的校正和补充。
“软件推导”补硬件不足
生物学的研究方法一直是所见即所得，这次引入了信息论的方法，利用冗余信息、通过计算得出准确结论，陆祖宏认为，ECC测序法是对上面提到的2代测序方法的完善，其基本原理与2代测序方法相一致，令人称道的是其打破思维定势，迂回计算出碱基信息。
打个比方，要解答“甲乙丙丁分别住在哪个房子里，”之前的方式是直接开门看，ECC是通过测量得到一组逻辑题，诸如红房子在蓝房子的右边，白房子的左边；黄房子的主人来自香港，而且他的房子不在最左边，爱吃比萨的人住在爱喝矿泉水的人的隔壁……等等提示，通过计算最终判断出结论。
