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生信爆款入门-第12期(今年最后一期)

生信菜鸟团  · 公众号  · 生物  · 2021-01-02 18:07

正文


生信技能树的粉丝都知道我们有一个全国巡讲的良心学习班,口碑爆棚,生物信息学入门省心省时省力!先看看大家的反馈吧:

2020疫情严重,在保质保量的高标准严要求下,我们教学团队仍然艰苦奋斗把这些好内容 全面线上化 不要犹豫了, 滑到文末 ,找到生信技能树官方报名小助手微信 ,直接扫描二维码进行咨询并且报名参加, 2021年的1月4号开课 ,长达3周直播辅导互动答疑你值得拥有,这绝对会是你人生最正确的决定之一。明年应该是3月份之后根据疫情被控制的情况选择性开启线下全国巡讲哦,敬请期待。

我们的生信爆款入门学习班每到一个城市,当地的小伙伴们口碑传播的比我们生信技能树自媒体矩阵还积极!已经打磨成为了 标准品 ,市面上最快速的帮大家系统性入门生物信息学的绝佳课程,下面是 2019的宣传推文列表

而且我们一直在收集学员们的反馈 ,逐步改进课程内容设置,研发好授课技巧,注重学员回访,一起进步!

本来呢, 2020我们会在2019的基础上面增加: 南昌,太原,海口,厦门,青岛,沈阳 等城市哦, 希望大家在学校门口等我们即可!但是,计划赶不上变化,一场席卷大江南北的新冠病毒疫情让我们防不胜防,为最大程度保护我们的巡讲授课团队和粉丝们,至少得取消10个以上的城市上门授课服务。

如果你计划在你的城市提供场地,欢迎联系生信技能树创始人jimmy,协商时间地点,见 一年一度的生信爆款入门全球听限量免费活动又来啦!

以前是课程虽好,但名额稀少

参加过其他培训的朋友都知道,市面上的培训班 两天的收费就要三千 以上,学费、路费和住宿费加起来,正常花费在6000元上下。很多培训班的举办方的还不是专业做培训,而是作为公司宣传的一个渠道。参加过的都懂,没有人为你的学习负责,大家只是做好分内之事依靠那个商业模式赚钱罢了, 动辄招生一百来号人 ,酒店会议室 现场乌压压 的一片,授课效果可想而知。

而我们全国巡讲的良心学习班,由于时间限制,不可能达到 全国300个城市 一一覆盖,只能说挑选粉丝聚集地城市,大家就近入学,理论上一个城市我们一年只去一次(特大城市除外),错过等明年(还不一定能等到)。

依据2019的全国巡讲经验来看,即使我们成功到达了大家的城市,也会部分朋友 出现时间冲突 ,比如恰好那几天考证或者值班等等,所以看到一些广州中山大学的朋友跑去长沙,一些上海的朋友跑去南京或者杭州。而且小城市我们其实是 限制培训班学员数量的 ,通常是20人,这样又导致一大波人无法报名,搞得好像我们在弄饥饿营销策略。

再加上我们还有17%的海外用户,2019的全国巡讲 我只看到 暑假的时候有3个趁假期飞回国赶上我们学习班的, 大量海外朋友 都因为各种条件限制被忽略了,我们也时候做些什么来帮助他们了。

综上所述,我们生信技能树教学团队推出2020全国巡讲全球听的全新教学项目,希望尽最大可能帮助大家利用好自己的数据项目,为你的科研事业增光添彩!报名之后, 可以自由选择任意形式学习方式 ,可以只参加网课直播,也可以选择一次线下课,或者两个都选!

授课形式

全国巡讲线下课程 持续3天,每天朝九晚六,授课8个小时 ,所以给大家发的结业证书是24个小时的学习量。 待疫情结束,我们仍然是会进行线下全国巡讲,保证每个月至少2次,不同的城市。 大家只需要一次报名,即可选择任意城市参加一次线下课程,还能 同时参加视频直播课程 ,提前学! (线上线下相结合!

全网视频直播课程

全国巡讲线下课程大家看我们的往期介绍即可,授课知识点目录在 生信入门课全国巡讲2019收官--长沙站 。而全网视频直播课程,我们 尽量模拟 线下课程的体验,开课前期有专门的助教一对一解决数据处理 电脑环境的准备工作 问题,报名费与线下培训费用一致(3199元),提供发票、会议通知等文件方便报销。

如果你已经看完了我们生信技能树B站100个小时视频,而且能看懂,请不要报名, 即使你再怎么想感谢我,一定要来支持我,也无需报名! 我们不是乞丐,你 帮忙推荐给真正有需要的师弟师妹即可。

课程中间授课知识点和互随堂作业习题交织,着重强调互动体验!

24小时线下集训学习量变成 60个小时的线上 全网直播视频课程, 连续4个星期,每个星期5天,每天的晚上8~11点 的3个小时互动授课 (周三、周日休息)

内容安排如下:

  • 第一周R语言

    • R语言数据类型与数据结构

    • 函数与R包

    • 文件读写

    • R语言作图

    • 拓展补充部分

  • 第二周GEO数据挖掘

    • GEO数据库介绍

    • 数据下载和质控

    • 样本分类与芯片注释获取

    • 差异分析和富集分析

    • 多分组数据处理和多数据集处理

    • 蛋白互作网络绘制

  • 第三周Linux

    • 服务器登录和Linux操作系统认知,基本文本文件及目录操作

    • 文本处理三驾马车(awk,sed,grep)实战演练,基于gencode数据库human的gtf文件

    • conda管理生物信息学软件,环境变量

    • 相对路径和绝对路径,通配符及参数扩展,快捷方式

    • 批处理和脚本编程

  • 第四周RNA-seq实战

    • 生物信息学常见数据格式,fastq,fasta,sam,bam,vcf,gtf

    • 转录组背景知识

    • 转录组上游流程,文献测序数据下载到质控,比对,定量,拿到表达矩阵

    • 转录组下游分析,3大R包走转录组表达矩阵的差异分析,富集分析,GSEA

    • 其它NGS组学介绍

直播期间将穿插练习,讲练结合,充分互动,强调在实战中进步。讲师分章节在线授课及答疑,突发情况可在线求助我们的助教团队,课堂进度也会根据学员们的理解程度灵活作调整。

课程会录屏并且编辑好发给大家,哪怕中间缺一次课,也可以其它时间尤其是周六日补起来。但是缺太多可能有问题,所以大家需要迁就一下我们的时间安排: 连续4个星期,每个星期5天,每天的北京时间晚上8~11点

即使你赶不上直播课程,或者始终觉得线上学习效果不好,仍然是可以选择继续 就近参加一次我们不同城市的线下学习班的 。(注:线下蹭课需额外缴纳500元的场地公摊费)

第一个福利:买一得五

报名2020全国巡讲全球听的全新教学项目者,除了可以参加60个小时的线上视频直播课程,以及一次任意城市的线下学习班之外,还可以继续享受5个福利:

价值3199的Linux系统入门视频及配套习题免费领取

  • Linux云服务认识及登录

  • 操作系统目录和文件操作

  • 文本处理基础及进阶三驾马车

  • 元字符,通配符及shell中的各种扩展

  • 软硬链接,绝对路径和相对路径,环境变量

  • 任务提交及批处理

  • 软件安装及管理

  • 其它视频课程及PDF书籍全套

价值3199的R语言系统入门视频及配套习题免费领取

  • 了解常量和变量概念

  • 加减乘除等运算(计算器)

  • 多种数据类型(数值,字符,逻辑,因子)

  • 多种数据结构(向量,矩阵,数组,数据框,列表)

  • 文件读取和写出

  • 简单统计可视化

  • 无限量函数学习

  • 其它视频课程及PDF书籍全套

价值3199的RNA-seq数据分析视频及配套习题免费领取

RNA-seq我们在生信技能树应该是至少推出了 400篇教程 ,而且是我们 全国巡讲 的标准品知识点,其中还有一个阅读量过两万的综述翻译及其 细节知识点 的补充:

但凡有Linux基础以及R语言认知,听完了我B站的RNA-seq分析流程都是可以迅速上手自己的项目啦!

而且我们还继续赠送 单细胞转录组数据分析课程

价值3199的GEO和TCGA数据挖掘视频及配套习题免费领取

GEO数据挖掘视频我们已经打磨好了多套无脑代码,在: 一个甲基化芯片信号值矩阵差异分析的标准代码 ,和 免费的数据分析付费的成品代码 。当然了,需要你具备R语言基础知识,才有可能看得懂和使用我们的完美代码!再比如 3 年前的收费视频课程: 3年前的GEO数据挖掘课程你可以听3小时或者3天甚至3个月 ,也是直接免费在B站:

  • 这个课程超级棒,B站免费学习咯:https://m.bilibili.com/video/BV1dy4y1C7jz
  • 配套代码在GitHub哈:https://github.com/jmzeng1314/GSE76275-TNBC
  • TCGA数据库挖掘,代码在:https://github.com/jmzeng1314/TCGA_BRCA
  • GTEx数据库挖掘,代码在:https://github.com/jmzeng1314/gtex_BRCA
  • METABRIC数据库挖掘,代码在:https://github.com/jmzeng1314/METABRIC

然后马上就有了一千多学习量,而且有学员给出来了图文并茂版本万字笔记,让我非常感动! 扫描下面二维码马上就可以学习起来啦,笔记需要至少半个小时来阅读哦!

当然,前提是你至少 生信入门 了!不然,海量的学习资源对你来说仅仅是空中楼阁。

关于TCGA数据挖掘,大多数需求其实也就是差异和相关性,生存分析等等,我们的视频目录如下:

  • P1-TCGA-101-课程介绍-需要哪些背景知识

  • P2-TCGA-102-课程导读-如何使用我的github代码

  • P3-TCGA-103--TCGA数据库大有作用-不仅仅是灌水

  • P4-TCGA-201-背景介绍及网页工具大全

  • P5-TCGA-202-其它数据库介绍

  • P6-TCGA-203-使用Xena网页工具

  • P7-TCGA-204-使用firehose网页工具

  • P8-TCGA-205-文章规律讲解

  • P9-TCGA-301-数据下载方式导言

  • P10-TCGA-302-GDC下载数据实战

  • P11-TCGA-303-GDC数据整理

  • P12-TCGA-304-GDC下载数据续集

  • P13-TCGA-305-R-TCGA包下载数据及数据提取

  • P14-TCGA-306-使用GDC和firehose下载-TCGA的胃癌的甲基化信息数据

  • P15-TCGA-307-使用GDC和Xena下载RNA-Seq的表达矩阵并且比较

还有很多学员笔记: 4个小时TCGA肿瘤数据库知识图谱视频教程又有学习笔记啦

价值3199的表观调控等多组学分析视频及配套习题免费领取

  • 01 果蝇参考基因组和注释文件准备

  • 02 文献测序原始数据下载

  • 03 ChIP-seq 数据质量控制与过滤

  • 04 ChIP-seq 数据从比对到 Peaks calling

  • 05 RNA-seq 数据从比对到定量

  • 06 用幕布展示此课程目录

  • 07 验证目标基因的指定外显子 knock out 是否有效

  • 08 多个样本基因信号矩阵来相关性计算与可视化

  • 09 对RNA-seq数据找差异基因以及可视化

  • 10 根据差异倍数来计算样本间相关性

  • 11 使用 ChIPseeker 对单组 Peak 进行注释与可视化







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