专栏名称: 药用植物研究前沿
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【中药资源】中国林科院资源昆虫研究所李正红、马宏研究团队在药食同源植物余甘子遗传多样性和居群动态研究中取得进展

药用植物研究前沿  · 公众号  ·  · 2020-12-04 09:45

正文

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内容来源于中国林科院

余甘子( Phyllanthus emblica L. )隶属叶下珠科( Phyllanthaceae )叶下珠属( Phyllanthus ),是一种分布于热带和亚热带地区的重要食药同源经济树种。其叶片、茎皮、根和果实因含有多种药用成分如维生素 C 、类黄酮、羽扇豆醇、没食子酸、余甘子酚和超氧化物歧化酶( SOD )等而被许多少数民族作为日常用药,多种治疗功效(如抗氧化、抗病原微生物、抗肿瘤、保肝等)在现代医药学研究中也已被证实,世界卫生组织将其列为在世界范围内推广种植的三种保健植物之一。在中国,余甘子广泛分布于华南和西南地区。然而,由于近年来大量砍伐森林和开垦土地以及自然栖息地的恶化,该物种的野生资源急剧减少,迄今为止很难见到林相整齐的野生余甘子林。
为有效保护和合理利用该物种,中国林科院资源昆虫研究所李正红、马宏研究团队利用开发的 20 个多态性 EST-SSR 标记,对云南干旱气候区和广西湿润气候区共 10 个居群 260 个个体的遗传多样性、遗传结构和居群动态进行了研究。
遗传多样性和遗传结构分析表明,余甘子在物种( H e = 0.796 )和居群内( H e = 0.792 )遗传多样性水平较高,而居群间遗传分化较小( F ST = 0.084 ),遗传变异主要存在于居群内( 92.44% )。综合运用 NJ 树、 STRUCTURE 层次聚类和主坐标分析对采样居群的遗传结构分析推断,采样个体可被分为两个不同的遗传群体(图 1 )。


1. 基于 S TRUCTURE Neighbor-joining ( NJ) 树和主坐标分析 (PCoA) 的余甘子居群遗传结构
相比之下,干旱气候类群的遗传多样性( He = 0.786, N a = 11.790, I = 1.962 )高于湿润气候类群( He = 0.673, N a = 9.060, I = 1.555 ),这可能是海拔、降水量和地理距离的综合影响;有趣的是,只有海拔和降水量对遗传多样性具有显著的纯影响( pure effects ),且前者略强(图 2 )。

2. 遗传多样性参数( Bray–Curtis 距离)和解释距离(地理和环境(海拔或降水)距离)间相关性的 partial Mantel tests
利用 DIYABC 法对居群动态的分析表明,余甘子在末次盛冰期早期( the beginning of LGM )经历了遗传瓶颈,有效居群大小有所缩减(图 3 )。

3. 最优 DIYABC 模型( Scenario 7 )有效居群大小及其过渡时间估算示意图
这些遗传特征为余甘子遗传资源的保护和可持续发展提供了重要的信息,也为云南干热河谷和广西喀斯特地区的生态恢复和经济发展提供了新的见解和指南。
以上研究结果以 “Genetic diversity of Phyllanthus emblica






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